18 января 1944 г. обер-бургомистр Вены Ханнес Блашке в знак признания заслуг Новотны вручил ему «Почетное кольцо» города Вены. Это был массивный золотой перстень с гербом города. А уже 20 января он вместе с оберстом Ханнесом Траутлофтом, майором Рейнхардом Зейлером и гауптманом Вальдемаром Вюбке в качестве почетного гостя посетил фабрику по выпуску пишущих машинок в городке Целла-Мелис, в 44 км юго-западнее Эрфурта.
В конце января Новотны вернулся в I./JG54, которая тогда уже базировалась в Орше. Однако он пробыл там всего несколько дней, так как уже 4 февраля его назначили командиром JG101, чей штаб располагался в городе По, на юге Франции. Хотя формально это была учебно-боевая эскадра, но в ее составе на тот момент имелась только одна группа – I./JG101 во главе с майором Отто Бертрамом. Несомненно, что такое назначение Новотны было вызвано желанием командования отправить его подальше от фронта. Ведь к тому времени из шести кавалеров Бриллиантов из числа Люфтваффе в живых оставались лишь четверо.
6 июня того же 44-го года союзные войска высадились в Нормандии. Поэтому 20 июня JG101 была переброшена в Германию, на аэродром Бад-Верисхофен, в 73 км юго-западнее Мюнхена. Немецкие истребители вели над Францией ожесточенные бои с авиацией союзников, а Новотны по-прежнему продолжал руководить в тылу учебно-боевой эскадрой, фактически бывшей лишь группой.
Ему казалось, что руководство Люфтваффе совсем забыло о нем. Подготовка молодых пилотов, которую он поначалу воспринял с большим энтузиазмом, больше не приносила ему удовлетворения. В этот период Новотны в письме к своему старому другу Шнорреру, который в тот момент в составе EKdo262 уже летал на реактивном Ме262, писал:
В сентябре командование Люфтваффе наконец вспомнило о Новотны. Сначала 1 сентября ему присвоили звание майора, а потом 26 сентября приказом инспектора истребительной авиации генерал майора Галланда назначили командиром III./JG6. Группу планировалось полностью вооружить реактивными истребителями Ме262. Галланд надеялся, что во главе с известным асом она сможет добиться достаточного числа побед, чтобы окончательно убедить Геринга и Гитлера использовать Ме262 исключительно в качестве истребителя.
Прибыв на аэродром Ахмер, в 15 км северо-западнее Оснабрюкка, Новотны с энтузиазмом и энергией немедленно приступил к созданию необходимой наземной инфраструктуры. Это должно было создать условия для скорейшего ввода группы в бой, чего и ожидало от него высшее командование. Используя свое имя, он «выбил» у гауляйтера Северной Вестфалии доктора Альфреда Мейера достаточное количество рабочих, чтобы подготовить Ахмер, а также аэродром Хезепе, расположенный в 20 км севернее Оснабрюкка, к приему Ме262. Одновременно по его просьбе с фирм «Мессершмитт» и «Юнкерс» был прислан необходимый технический персонал для обслуживания самолетов.
Благодаря стараниям Новотны, а также усилиям наземного персонала их бывшей III./ZG26, прибывшего 30 сентября в Ахмер и Хезепе, оба аэродрома через несколько дней были готовы к приему и обслуживанию реактивных «Мессершмиттов». 2 октября вошел в строй командный пункт группы. К началу октября в III./JG6 имелось 23 Ме262А1а. В течение 3 и 4 октября 8./JG6 перебазировалась в Хезепе, а 9./JG6 – в Ахмер.
Предполагалось, что все пилоты должны были пройти интенсивную переподготовку на реактивный «Мессершмитт». На практике же оказалось, что только летчики, ранее летавшие в составе опытного командования «Лехфельд», имели достаточный опыт полетов, остальные же, включая самого Новотны, успели совершить лишь по два-три ознакомительных полета на Ме262. Именно сочетание пилотов, недостаточно хорошо освоивших новый самолет, и недостатков конструкции самого истребителя, впоследствии привело к катастрофическим результатам.
Однако необходимо отметить, что, несмотря на все технические проблемы, Ме262 в руках опытных пилотов был мощным оружием, что доказал Новотны. 7 октября бомбардировщики из 8-й воздушной армии США совершили налеты на цели в районе Магдебурга, Касселя и Цвиккау, при этом их маршрут пролегал именно мимо Ахмера. Быстро взлетев, командир III./JG6 на высоте 5000 метров в районе городка Брамше, в 4 км восточнее Ахмера, атаковал и сбил В24.