Согласно составленной им программе, все корабли отряда испытывали весьма интенсивно, выполняя параллельно и множество боевых упражнений. Так, например, при испытании артиллерии проводилось четыре вида стрельб: на скорость, точность попадания, определение максимальных углов обстрела и ночные стрельбы с освещением цели прожекторами.
Ходовые испытания проводились на полном ходу, экономическом (с половинным числом действующих котлов), управляли кораблем только при помощи винтов, а также определяли диаметр циркуляции. Особое внимание С.О. Макаров уделял проверке водоотливных систем и герметичности водонепроницаемых переборок.
14 июня 1894 г. машины «Наварина» прошли швартовые испытания, и 27 июня броненосец начал свою вторую кампанию. Через два дня прошли и испытания машин на ходу. Оказалось, что недостаточная паропроизводительность котлов так и не позволила достичь проектных 9000 л/с. Следовало усилить тягу. Общество предложило МТК два варианта: увеличить высоту труб (на 10 м!!!) или же установить 10 дополнительных вентиляторов. В конечном итоге остановились на втором варианте, планируя завершить все работы к будущей кампании.
Одновременно с испытаниями установили и часть брони, а доставленные из Франции с завода Сен-Шамона четыре башенные плиты с прорезями для амбразур в конце кампании прикрепили на деревянную подкладку к каркасам башен.
В действительности Общество Франко-Русских заводов все работы выполнило только в ноябре 1894 г., то есть с задержкой на 18 месяцев, хотя на «Наварине» к тому времени еще не была установлена часть артиллерии. Но за свои просчеты Морское министерство ответственности не несло.
В конце лета 1895 г. для испытания достраивающихся кораблей: — броненосца «Наварин», броненосца береговой обороны «Адмирал Ушаков», броненосного крейсера «Рюрик» и миноносцев № 119 и № 120 под председательством контр-адмирала Б.К. Де-Ливрона (незадолго до этого он успел побыть в должности командира «Наварина») образовали специальную комиссию. Флагманом вновь образованного отряда стал «Адмирал Ушаков». На нем адмирал 15 августа и поднял свой флаг. Около месяца спустя, 12 сентября начал кампанию и «Наварин». В основном испытывали только главные и вспомогательные механизмы, так как артиллерию на корабле установили только летом и она имела множество недоделок.
23 сентября «Наварин» вышел на заводскую пробу машин и определение девиации. Машины в основном обслуживали заводские рабочие. Они сумели довести давление пара до 130 фунтов, и машины развили по 90 оборотов. Но, несмотря на то что машины «работали плавно и не грелись», броненосец развил скорость чуть более 15 узлов.
Следующий выход в море состоялся 29 сентября. Совместно с представителями Франко-Русского завода провели шестичасовые испытания. Имея водоизмещение 10107 тонн, броненосец развил скорость 16,3 узла. Перегрузка при этом составила 631,4 тонн или 6,6 % от проектного (9437 т) водоизмещения. При более точных расчетах перегрузка корпуса определялась в 274 т, механизмов 308 т, брони 12 т, артиллерии 30 т и снабжения 7 т. 10 ноября прошли официальные испытания. На этот раз при мощности 9194 л.с. (давление 135 фунтов и 94 оборота винта) среднюю скорость на пробе развили только 15,85 узла (правда, на одном из пробегов достигли 16,14 узлов).
Комиссия под председательством главного инспектора по механической части инженер-механика. Н.Г. Нозикова засвидетельствовала, что «пар держался легко, и механизм действовал с постоянным числом оборотов, весьма спокойно и без разогревания».
Испытания окончились, и «Наварин» ушел в Ревель. Там предстояло начать испытание торпедных аппаратов. Произведя несколько выстрелов из каждого аппарата, броненосец вернулся в Кронштадт, и 14 декабря на нем спустили вымпел. Трехмесячная кампания окончилась.