Практическая деятельность флота в 1903 г. после подготовки по программе одиночного корабля закончилась двумя непродолжительными учебными походами, первым с 23 ноября в среднюю часть Балтийского моря, вторым с 1 декабря в пролив Скагеррак с одним днем стоянки на якоре у Фредериксхафена. 12 декабря «Кайзер Барбаросса» вывели из состава соединения флота в ремонт. Окончательное устранение повреждений продолжалось до января 1905 г. После этого на нем первом из кораблей серии, начали давно запланированную модернизацию.
«Кайзер Барбаросса» модернизировали в два этапа. Первый этап закончили в 1904 г, второй этап осенью 1907 г.
Как и прежде, в 1904 г. «Кайзер Фридрих III» нёс свою обычную службу в составе 1-й эскадры. Соединение разведывательных кораблей первым приступило к практической деятельности. Уже 11 января оно вышло из Киля в свой 10- дневный поход в Скагеррак и 21 января вернулось назад, причём из-за начавшегося большого пожара на флагманском броненосном крейсере «Принц Генрих» пришлось зайти в норвежскую гавань Альзунд. Второе учение разведывательное соединение предприняло с 8 по 17 марта.
Если 1903 г. для линкора «Кайзер Вильгельм дер Г россе» проходил по обычному плану, то осенью 1904 г. эти планы были прерваны временной передачей корабля до весны 1905 г. в состав 2-й эскадры.
После весенней смены мест базирования для кораблей действующего линейного флота начался новый учебный год. В мае в Северном море провели крупное учение всего флота совместно с двумя флотилиями миноносцев.
Этот год был примечателен тем, что сразу после учений в северной части Северного моря, проходящих вплоть до берегов Норвегии, состоялся вызвавший много толков поход к берегам Англии и Шотландии. Во время этого похода линкоры посетили порты Плимут, Флиссинген, Лервик (Шетландские острова) и Мольде. Часть учебного похода на борту флагманского корабля провёл начальник морского генерального штаба адмирал Бюксель.
Июнь прошёл под знаком «Кильской недели» 1904 г., при этом Киль посетил британский король Эдуард VII со своей свитой. В её состав входили Первый лорд Адмиралтейства Селборн и начальник департамента морской разведки принц Луи Баттенбегский (по национальности немец).
Это посещение представителей британского королевского дома и Адмиралтейства и последовавший показ всего корабельного состава кайзеровского военно-морского флота, произведённый по приказу Вильгельма II, дало повод немецкой прессе начать резкую критику действий кайзера. При этом не забыли припомнить, что британский король посетил также германский флагманский корабль.
Но ещё большую критику, чем это посещение, вызвало последующее распоряжение кайзера, согласно которому даже отложили на несколько дней срок выхода германского действующего линейного флота в длительным летний поход. Распоряжение гласило, что германская эскадра во время учебного похода должна была обязательно зайти в какой-либо английский порт.
6 июля действующий линейный флот в полном составе покинул Киль и начал проводить учения в Германской бухте. У острова Боркум обе эскадры разошлись. В то время как входящие в состав 2-й эскадры броненосный крейсер «Фридрих Карл» и миноносцы по-прежнему продолжали проводить учения, 1-я эскадра и соединение разведывательных кораблей направились в Плимут.
Прибыв в Плимут 10 июля, немцы были поражены столь неучтивым приёмом со стороны англичан, так как из кораблей британского флота в гавани находился только один броненосный крейсер «Монмут», что вызвало довольно неприятное удивление. Из-за этого хорошо задуманный германским кайзером дружественный визит оказался сорван. Кульминационным пунктом явилось посещение флагманского корабля командующего германским флотом начальником военно-морской базы адмиралом Сеймуром.
13 июля корабли германской эскадры и разведывательного соединения покинули Плимут, тронулись в обратный путь и 14 июля бросили якоря на рейде Флисссингена, а соединение разведывательных кораблей проследовало в нидерландскую военно-морскую базу Ден-Хелдер. Туда же прибыла и 2-я эскадра с флотилиями миноносцев.
Запланированное посещение королевой Нидерландов Вильгельминой германских кораблей не состоялось. Принимающая сторона неожиданно отменила этот визит, причём ходили слухи о политической причине этого отказа.
20 июля весь германский флот покинул нидерландские воды и продолжил проведение учений. В них также принял участие начальник морского генерального штаба вице-адмирал Бюксель, который ещё во Флиссингене прибыл на борт линкора «Кайзер Фридрих 111».
Поход флота сначала проходил в северном направлении вдоль английского побережья до Лервика (Шетландские острова), затем с 25 июля дальше через северную часть Северного моря. 1-я эскадра 29 июля зашла в Мольде, а соединение разведывательных кораблей в Христитиансанд. 2-я эскадра с флотилиями миноносцев в тот же день прибыла в Берген.