За десять минут Орджоникидзе изложил программу действий на ближайшие месяцы. Сибирская делегация покинула Петроград, снабженная точными инструкциями.
Иркутский комитет большевиков образовал военную организацию (военку), которая занялась подготовкой к вооруженной борьбе. Быстро развернулась пропагандистская работа среди солдат гарнизона, начали создаваться рабочие красногвардейские отряды.
23 октября 1917 года был избран Центральный исполнительный комитет Советов Сибири — Центросибирь, в который вошли: Б.3. Шумяцкий (председатель), Р.П. Эдеман (заместитель председателя), М.А. Трилиссер, П.П. Постышев, Я.Д. Янсон, С.Г. Лазо и другие. Центросибирь и созданные им советские учреждения разместились в так называемом «Белом доме», где раньше находилась резиденция генерал-губернатора.
Известия о победе Октябрьской революции были получены в Иркутске 27 октября 1917 года. Центросибирь приветствовал победу революции и принял меры к переходу власти в Сибири в руки рабочих и крестьян. Но в Иркутске этот переход затянулся, и только 19 ноября Иркутский Совет рабочих и солдатских депутатов объявил о взятии всей власти в городе в руки Совета и создал военно-революционный комитет. Михаил Трилиссер вошел в состав оперативного штаба, созданного для управления вооруженными силами губернии.
28 ноября военно-революционный комитет собрал представителей всех частей иркутского гарнизона. Собрание приняло резолюцию, одобряющую деятельность военно-революционного комитета.
На совещании актива большевистской организации, созванном в «Белом доме», было принято решение об аресте деятелей Временного правительства и о посылке в учреждения комиссаров.
В ответ на это забастовали служащие и чиновники. В город прибывали офицеры, бежавшие из Петрограда и Других городов России. Они вместе с эсеро-меньшевистскими вожаками усиленно обрабатывали юнкеров местного училища, чтобы они выступили против Советов.
В эти дни Трилиссеру было поручено организовать работу по борьбе с контрреволюцией. С помощью красногвардейцев был сорван крупный мятеж. Ряд групп заговорщиков большевики успели обезвредить, но полностью предотвратить мятеж не удалось.
8 декабря юнкерские и офицерские отряды, насчитывающие более трех тысяч человек, перешли в наступление. Красногвардейские отряды сражались мужественно но к концу дня белогвардейцы захватили центральную часть города. «Белый дом» сразу был отрезан от преданных Советской власти войск и оказался в окружении противника.
Трилиссер возглавил штаб обороны Центросибири. Небольшой гарнизон в течение десяти дней отражал многочисленные атаки противника, превосходящего по своим силам в несколько раз силы оборонявшихся, пока подоспевшие красногвардейские части не подавили мятеж.
Контрреволюция поднимала голову по всей Восточной Сибири и Забайкалью. Нужно было срочно комплектовать отряды Красной Армии. Президиум Центросибири утвердил Сибирсюш военный комиссариат по созданию Советских вооруженных сил Сибири. М.А. Трилиссер вошел в состав комиссариата вместе с С.Г. Лазо, С.Г. Вележевым, А.Н. Луцким.
…Февраль 1918 года. Ночью в кабинет к Трилиссеру, только что назначенному начальником пограничного отдела, вошел мужчина… По безупречной выправке, по манере держаться Михаил Абрамович сразу определил в нем кадрового офицера. Тотчас узнал, хотя видел всего один раз.
— Разрешите представиться! — Офицер держался спокойно. — Штабс-капитан Луцкий прибыл в ваше распоряжение.
— Здравствуйте, товарищ Луцкий! — Трилиссер, обрадовавшись, поднялся навстречу. — Присаживайтесь. Я уже стал беспокоиться, уж не случилось ли что! Время-то такое!
Луцкий сел на стул и сказал:
— Только что был в частях, выделенных для нашего пограничного отдела. Познакомился с командирами и бойцами. Хорошие солдаты. Пришлось походить по улицам, чтобы попасть из отряда в отряд, ведь с транспортом плохо. Промерз основательно… Михаил Абрамович, с чего будем начинать? — Луцкий говорил собранно, деловито. Повернулся к карте, висящей на стене, и кивком показал: — Во-он она какая, граница!
— Вот об этом я и хотел вас спросить, — улыбнулся Трилиссер, усаживаясь рядом. — Но вы меня опередили. Я буду у вас учиться, и ваша помощь мне очень нужна.
— Будем учиться друг у друга, — улыбнулся Алексей Николаевич, потом стал излагать свой план: — Прежде всего нужно разработать систему охраны границы. Необходимы войсковые подразделения для нарядов и засад. Нужно определить места для контрольно-пропускных пунктов. Потребуются частые поездки на границу… Мне нужно будет восстановить кое-какие контакты на той стороне, особенно в Харбине, чтобы располагать необходимой информацией. Видимо, и вам полезно будет съездить со мной в Маньчжурию. В последующем это вам пригодится.