В 1573 году был создан Бронный приказ, руководивший изготовлением ручного холодного и огнестрельного оружия. В России было широко развито изготовление копий, шлемов, кольчуг, панцирей, саблей, мушкетов, пищалей.
Известно о деятельности с 1577 года Пушкарского приказа, ведавшего кроме артиллерии – огнестрельного наряда, также строительством пограничных городов и укреплений. Впоследствии строительством занимался Приказ каменных дел, организованный в 1583 году. Главным арсеналом русского войска была Москва. Пушки лили и во Владимире, Устюжне, Великом Новгороде и Пскове. Общее число пушек в Московском царстве к концу XVI веке, по свидетельствам иностранцев, превышало 2000 штук.
Ямской приказ был создан в 1574 году и обеспечивал военные сообщения, содержал на дорогах ямы – почтовые станции, на которых меняли лошадей, с большим штатом ямских охотников – ямщиков, собирал ямской налог. В больших городах были организованы ямские слободы с казенными лошадьми, телегами и санями. В середине XVI века в стране насчитывалось более трехсот ямов.
Аптекарский приказ с конца XVI века обслуживал царя, династию и близких к царю лиц. При первых Романовых стал общегосударственным органом, ведавшим вопросами медицинской службы.
Приказ Большого дворца, с 1501 года возглавлялся дворецким и двумя дьяками, и снабжал Государев двор всем необходимым, включая пополнение казны. Приказ заведовал царским хозяйством, обслуживающим персоналом двора, управлял дворцовыми землями, дворцовыми крестьянами; осуществлял контрольные функции.
Приказ Большой казны играл роль главной дворцовой канцелярии и архива и даже руководил внешней политикой. Казенный приказ 1512 года хранил особо важные документы, вещевую и наградную казну, резервный и финансовый фонд, вел торговые операции для царских нужд. Возглавлявший приказ казначей ведал дипломатическими вопросами, ямскими, поместными делами; печатник хранил большую государственную печать.
Приказ Большого прихода с 1534 года ведал сбором налогов, преимущественно военного назначения «на городовое, засечное, пороховое дело».
Приказ Великого княжества Литовского в 1657–1675 годах управлял завоеванными землями Речи Посполитой.
Иноземный приказ с 1624 года ведал службой иностранцев и солдат, служивших в полках нового, «иноземного строя».
Важнейшей придворной должностью являлся чин конюшего, возглавлявшего и Конюшенный приказ, комплектовавшего конные полки. С XVI века конюшие активно участвовали в дипломатической и военной деятельности, возглавляли правительство – Ближнюю Думу. Последний конюший чин был пожалован в 1605 году. Во главе Конюшенного приказа стояли ясельничие, ведавшие царской охотой.
Приказ Великой России ведал землями слободских полков – Сумского, Харьковского – перешедших в конце XVII века с украинских земель на российские земли.
Приказ городового дела с 1638 по 1644 год ведал строительством городов на южной границе России.
Приказ денежного и хлебного сбора в военное время собирал налоги на военное дело.
Доимочный приказ собирал недоимки прошлых лет.
Житный приказ ведал приемом и выдачей казенных припасов, поступивших для хранения на житные дворы.
Записной приказ в 1657–1659 годах занимался сбором материалов по истории династии Романовых.
Приказы золотых и серебряных дел ведал надзором за изготовлением ювелирных изделий для нужд двора.
Иконный приказ ведал дворцовыми иконописцами, работавшими в Иконописной палате.
Монастырский приказ ведал всеми монастырскими делами священнослужителей.
Посольский приказ ведал международными отношениями, возник в 1549 году, когда посольские дела были поручены дьяку И. Висковатову. Посольский приказ организовывал русские посольства за границу, принимал иностранных послов, назначал постоянных русских представителей к иностранным дворам, хранил государственные печати.
Приказ Казанского дворца управлял казанскими землями.
Приказ калмыцких дел вел переговоры с калмыцкими тайшами по поводу принятия ими русского подданства.
Приказ книгопечатного дела ведал работой Московского печатного двора.
Приказ купецких дел ведал оценкой мехов и пограничной торговлей русских купцов.
Приказ мушкетного дела ведал изготовлением ручного огнестрельного оружия.
Панский приказ ведал служилыми иностранцами из стран Западной Европы.
Патриарший судный приказ вел судебные дела о преступлениях против веры, назначал духовенство на должности.
Полоняничный приказ выкупал русское население, попавшее в плен. Печатный приказ ведал хранением и прикладыванием государственных печатей, сбором печатных пошлин. Историк делопроизводства средневековой России Н.П. Ерошкин писал: