Во время своих многочисленных заграничных путешествий в период между двумя Войнами Дюбуа с тревогой обращал внимание на то, что, не успев прийти в себя после первой мировой войны, не залечив еще страшные раны этого четырехлетнего побоища, мир стал вползать в новую мировую войну. Во время пятимесячного пребывания в Германии в 1936 году Дюбуа с омерзением смотрел на мутную волну расизма, захлестнувшую фашистскую Германию, на идеологическую подготовку новой мировой войны. И он воочию видел, что главное острие новой империалистической экспансии направляется против Страны Советов, страны, которая первой в мире провозгласила принцип равенства всех народов и воплотила его в жизнь. Ужасы второй мировой войны, десятки миллионов убитых и искалеченных, миллионы людей, погибших в печах крематориев и в концентрационных лагерях, разрушение многих тысяч городов и сел, уничтожение огромных материальных ценностей — все это еще больше укрепило антивоенные настроения Дюбуа, превратило его в активного участника антивоенного движения, развернувшегося в послевоенные годы.
Дюбуа возлагал значительные надежды на Организацию Объединенных Наций, видя в ней важный инструмент мира, орган, способный успешно содействовать мирному урегулированию послевоенных проблем. Дюбуа был назначен консультантом американской делегации на учредительную конференцию ООН в Сан-Франциско. Он использовал свои права консультанта для того, чтобы обратить внимание учредителей ООН на колониальный вопрос, без справедливого разрешения которого, по его мнению, не могло быть и речи о создании прочного мира.
16 мая 1945 года, обращаясь к учредителям ООН, Дюбуа заявлял, что стремление игнорировать права колониальных народов во Всеобщей декларации прав человека противоречит принципам, на которых должна создаваться ООН. «Если бы, — подчеркивал Дюбуа, — недвусмысленно было сказано, что свобода слова, свобода от нищеты и от страха, которые миролюбивые нации хотят обеспечить, должны распространяться и на 750 миллионов жителей колониальных стран, то это было бы великим историческим актом».
Дюбуа заявлял, что колониальные народы больше, чем кто-либо другой, заинтересованы в том, чтобы на них была распространена Всеобщая декларация прав человека, так как это самые угнетаемые в мире народы, они на девяносто процентов неграмотны, живут в страшной бедности, вымирают от эпидемий. «Трехсотлетняя эксплуатация этих народов, — подчеркивал Дюбуа, — являлась главной причиной войн, беспорядков и страданий».
Дюбуа дискутировал вопрос о правах колониальных народов с Джоном Фостером Даллесом и другими видными деятелями, но без какого-либо успеха. Его предложения не были поддержаны американской делегацией, отвергли их и делегации других империалистических держав.
Особый интерес Дюбуа по-прежнему проявлял к Африке. Он видел свою задачу в том, чтобы возродить забытое прошлое великих африканских цивилизаций, использовать это прошлое для развития национального самосознания африканских народов, для активизации национально-освободительного движения и построения независимых, суверенных африканских государств. В этом направлении Дюбуа работал многие годы, и когда в 1944 году он вернулся в Национальную ассоциацию содействия прогрессу цветного населения, то главное внимание он надеялся уделить изучению колониальных стран, изучению народов африканского происхождения.
Дюбуа надеялся также возобновить созыв Панафриканских конгрессов, работа которых была прервана мировым экономическим кризисом и второй мировой войной. В 1945 году Дюбуа удалось возродить свою мечту, он созвал пятый Панафриканский конгресс в Англии, в Манчестере.
Конгресс был созван в городе, являвшемся центром промышленной революции в Англии. Дюбуа писал, что в этой революции важную роль сыграла торговля черными рабами, жесточайшая эксплуатация негров-рабов, вывезенных из Африки. Когда семидесятисемилетний основатель панафриканского движения вошел в большой прямоугольный зал конгресса, его восторженно приветствовало молодое поколение борцов за освобождение Африки. Дюбуа обратил внимание на то, что из ста представителей африканских колоний, приехавших на конгресс, большинство были молодыми людьми, это было будущее независимой Африки.
Делегаты были преисполнены энтузиазма и решимости. Стены зала украшали лозунги, содержание которых отражало сдвиги в развитии национально-освободительного движения в Африке, происшедшие за время, прошедшее после созыва последних Панафриканских конгрессов. «Африка, проснись после долгой спячки!», «Африка для африканцев!», «Покончить с цветным барьером!», «Свободу всем угнетенным народам!», «Угнетенные народы мира, объединяйтесь!»
И даже в этом внешнем оформлении зала, в содержании лозунгов, под которыми проходил конгресс, чувствовалось влияние Дюбуа. Это были лозунги, которые выдвигались им на протяжении последних лет, воплощение которых в жизнь должно было привести к освобождению африканских народов от колониального ига.