Дюбуа не замедлил дать решительную отповедь этому «коммивояжеру холодной войны». В заявлении для печати, опубликованном 14 июля, руководитель Информационного центра, обращаясь к Ачесону, спрашивал: «Неужели стратегия нашей страны должна заключаться в том, чтобы всякий раз, когда Советский Союз призывает к миру, настаивать на войне? Неужели любые предложения о предотвращении атомной катастрофы должны отвергаться только из оппозиции к Советскому Союзу?» В заявлении Дюбуа подчеркивалась мысль о том, что силам реакции не удастся одурманить американский народ лживой пропагандой и вытравить из памяти американцев плодотворное советско-американское сотрудничество в борьбе с гитлеризмом.
Дюбуа выражал горячую веру в здравый смысл американского народа, в его готовность бороться против новой мировой войны. Обращаясь к Ачесону, он спрашивал: «Неужели вы» сэр, не допускаете, что есть честные американцы, которые, несмотря на свои разногласия в других вопросах, ненавидят войну, страшатся ее и полны решимости предпринять что-нибудь для того, чтобы ее предотвратить?»
Логическим следствием всей жизни Дюбуа явилось то, что он возглавил борьбу миллионов американцев, которые были «полны решимости» принять самое активное участие в борьбе за мир. И заслуга Дюбуа перед американским народом и всеми сторонниками мира была тем более велика, что он возглавил эту борьбу в очень ответственный момент и принял на себя тяжелый удар американской реакции.
Над руководимой Дюбуа организацией все более сгущались тучи. Вскоре он стал отчетливо чувствовать, что и лично вокруг него неумолимо замыкается цепь репрессий и преследований. В августе 1950 года Дюбуа получил приглашение принять участие в работе Бюро Постоянного комитета Всемирного конгресса сторонников мира в Праге. Десять дней молчал Вашингтон в ответ на просьбу Дюбуа дать ему разрешение на поездку в Прагу. Только после двух напоминаний просьба Дюбуа была удовлетворена, но срок его пребывания за границей был сокращен, наложен был также запрет на поездки в другие страны без специального разрешения государственного департамента. Дюбуа вспоминал: «Я чувствовал себя узником, которого освободили, взяв с него обещание вернуться в тюрьму к определенному сроку».
Ветеран прогрессивного движения в США, Дюбуа, выступая в Праге, мог на основании своего большого личного опыта заявить: «Никогда еще организованная реакция не обладала у нас такой властью, как и настоящее время, когда она владеет прессой и радио, ограничивает свободу слова, заключает в тюрьмы либеральных мыслителей и писателей. Сегодня в моей стране стало почти невозможно организовать даже митинг в защиту мира».
Дюбуа был убежденным оптимистом, даже в мертвящей обстановке антикоммунистической истерии, все более усиливавшейся в США, он верил в широкие массы граждан США, «которые в подавляющем большинстве ненавидят убийства, разрушение и безумие, выдаваемые за средства достижения прогресса». В своем выступлении в Праге Дюбуа изложил программу практических мероприятий для активизации борьбы за мир в США. «Но это, — подчеркивал он, — требует смелости и готовности к самопожертвованию». Скоро Дюбуа пришлось проявить и смелость и самопожертвование.
Осенью 1950 года началась прямая атака американских властей на Информационный центр. В августе 1950 года министерство юстиции впервые официально информировало руководство центра, что он занимается деятельностью, которая требует его регистрации в министерстве юстиции в качестве иностранного агента.
Руководство центра ответило на это провокационное предложение решительным отказом, и после повторного предупреждения со стороны министерства юстиции 8 февраля 1951 года суд присяжных в Вашингтоне известил Информационный центр сторонников мира о том, что центр и его сотрудники объявлены виновными в том, что они «не зарегистрировались как агенты иностранного патрона».
Открытое судебное преследование не испугало руководителей центра, которые в ответ на обвинительное заключение суда опубликовали обращение к общественности Соединенных Штатов в защиту своего права бороться за предотвращение новой мировой войны. В обращении говорилось, что обвиняемые не согласны с тем, что идея мира является иностранной идеей, и охотно признаются, что они собирали и распространяли повсюду информацию о движении в защиту мира и его идеи. В заключение подчеркивалось, что деятельность центра имеет исключительно важное значение, так как в настоящее время наиболее острой является необходимость в получении информации о движении в защиту мира и об усилиях для ликвидации угрозы третьей мировой войны.
Не желая выполнять провокационное требование о регистрации в качестве агента иностранной державы, руководство центра вынуждено было 12 октября 1950 года объявить о роспуске Информационного центра сторонников мира США. Но фактически эта организация продолжала свою деятельность до февраля 1951 года, когда суд вынес обвинительное заключение.