В дневнике обращают на себя внимание записи, связанные с пастырскими обязанностями священника вообще и с стремлением отца Иоанна стать «истинным пастырем». Особенно замечательна одна, которая во время ее появления в дневнике еще не носила личного характера, хотя внешне воспринимается именно так. И тем не менее, эта запись — четкое определение самого понятия «истинный пастырь», каковым, по мнению отца Иоанна, может стать только священник, полностью посвятивший себя «пользе общей», и каким стал впоследствии он сам. Не случайно эта запись спустя годы обретет другую форму — уже лишенную дневникового характера. Вот ее текст: «Истинный пастырь и отец своих пасомых будет жить в признательной памяти их и по смерти своей: они будут прославлять ого, и чем меньше он будет заботиться о своем прославлении здесь, на земле, при своих усердных трудах во спасение их, тем больше просияет слава его по смерти: он и мертвый будет заставлять их говорить о себе. Такова слава трудящимся на пользу общую» (Моя жизнь во Христе. — Полн. собр. соч. Т. 5. С.123). А в 1862 г. запись выглядит так: «Если я буду истинным пастырем и отцом вашим, то нанеред знаю, что буду жить в признательной памяти вашей и по смерти моей и вы будете прославлять меня, и чем меньше я буду заботиться о вашей о мне славе здесь — на земле — · при своих усердных трудах во спасение ваше, тем больше просияет слава моя по смерти: я и мертвый буду заставлять вас говорить о себе. Такова слава трудящимся на пользу общую»
Зафиксированы в дневнике и случаи исцелений по молитвам (случай с брандмейстером Василием Ивановичем и двумя младенцами — Павлом и Ольгой — с.357–358). Присутствует здесь и тема сложных отношений отца Иоанна с протоиереем Павлом Трачевским (см. об этом:
И конечно же, как и в других дневниках, в настоящем немало записей личного характера; среди них особенно выделяется одна: это благодарственное обращение ко Господу, представляющее по сути своей краткую автобиографию: от появления на свет от «добрых и благочестивых родителей» — к становлению, за которым наблюдали «добрые, попечительные и умные начальники и наставники»; упоминаются здесь и случаи неоднократного избавления от «болезней, нужд и бед» и даже от смерти. А главное, отец Иоанн возносит хвалу Господу за саму возможность священства — «сего равноангельскаго на земли служения и предстояния с Херувимами у страшна го Престола Твоего» (с.509–510).