За аурой комфорта и быстроты развития Пьерпонта скрывался беспокойный молодой человек. Его продолжали мучить головные боли, обмороки и кожные воспаления. В 1871 г. его партнер, Чарльз Дабни, ушел на пенсию, и их партнерство было расторгнуто. Не в последний раз Пьерпонт задумывался об уходе на пенсию. Словно не в силах остановить собственные амбиции, он то брал на себя огромную ответственность, то чувствовал себя подавленным. Казалось, он никогда не получал большого удовольствия от своих достижений и до конца жизни жаждал спокойного, но неуловимого мира.
После ухода Дабни на пенсию Джуниусу необходимо было найти партнера для Пирпонта. Он также хотел вывести Дом Моргана за пределы оси Нью-Йорк-Лондон и укрепить его международный бизнес ценных бумаг. Хотя мы считаем глобальные финансы современным изобретением, викторианские торговые банки уже были многонациональными по структуре и космополитичными по ориентации. Вместо филиалов они создавали взаимосвязанные партнерства в зарубежных столицах - именно то, что решил сделать Юниус. В январе 1871 г. в Лондоне к нему обратился Энтони Дж. Дрексел с предложением об объединении его филадельфийского банка с банком Морганов. Среди филадельфийских банков банк Дрекселя занимал второе место после банка Джея Кука в области государственного финансирования. Джуниус уже был лондонским корреспондентом Дрекселя. Как и тогда, когда к нему обратился Джордж Пибоди, к ногам Джуниуса было положено финансовое состояние. Он был не только самым искусным американским банкиром своего времени, но и самым удачливым.
Сын Фрэнсиса М. Дрекселя, странствующего австрийского художника-портретиста, ставшего финансистом, Тони Дрексель в сорок пять лет был стройным и утонченным, с гладким лбом, куполообразной головой, мягкими глазами и усами-рукоятками. В то время Уолл-стрит превращалась не только в поставщика, но и в импортера капитала, поскольку финансовая мощь тяготела к Нью-Йорку из Филадельфии и Бостона. Почувствовав сейсмический сдвиг, влиятельный Drexel пожелал укрепить свои нью-йоркские позиции. Как и в случае с Чарльзом Дабни, Джуниус надеялся подстраховать молодого Пирпонта и передать его под опеку старшего по возрасту человека. Поэтому он предложил Дрекселю взять Пьерпонта в качестве своего главного партнера в Нью-Йорке.
Какими бы выдающимися ни были дарования Пьерпонта, он все еще оставался глиной, вылепленной руками его отца. Джуниус убеждал его откликнуться на любое приглашение Дрекселя. Поэтому в мае он послушно отправился в Филадельфию, пообедал с Дрекселем и поболтал с ним после ужина. В Нью-Йорк он вернулся с договором о сотрудничестве, нацарапанным на конверте. Согласно договору, Пирпонт становился партнером компании Drexel and Company в Филадельфии и Drexel, Harjes в Париже. Он также должен был возглавить нью-йоркское партнерство под названием "Дрексель, Морган и компания". Порядок названий отражает значимость партнеров. Состояние Тони Дрекселя и двух его братьев , Фрэнсиса и Джозефа, составляло около 7 млн. долларов, в то время как у Пьерпонта было всего 350 тыс. долларов. Однако, чтобы сравнять счет, Джуниус вложил 5 млн. долларов. Пьерпонт всегда признавал свой долг перед отцом - он никогда не претендовал на самостоятельность - и позже сказал губернатору Нью-Йорка Гроверу Кливленду: "Если я смог добиться успеха на том жизненном посту, на который попал, то больше всего я обязан одобрению друзей моего отца".Новая компания Drexel, Morgan стала предшественницей J. P. Morgan and Company.
Перед подписанием сделки Пирпонт поставил любопытное условие - отложить работу над новым партнерством. Ему не терпелось приступить к работе, он чувствовал потребность в восстановлении сил после эмоциональных и физических потрясений. По всей видимости, он был на грани нервного срыва. По предписанию врача он взял пятнадцатимесячный отпуск, посетил Вену и Рим, совершил плавание по Нилу. На работе Пьерпонт никогда не мог расслабиться, и у него развилось сильное стремление к побегу. Он отдыхал по три месяца в год и шутил, что может выполнить двенадцать месяцев работы всего за девять месяцев. Его зять Герберт Сэттерли позже писал: "Казалось, он чувствовал себя лучше, когда действительно путешествовал, чем когда они где-нибудь оседали". В конце 1870-х годов, когда Пьерпонт попытался сбежать от работы, отправившись в отпуск в Саратогу (штат Нью-Йорк), за ним потянулась целая метель деловых писем и телеграмм. "Есть только один способ по-настоящему отдохнуть, - сказал он Джуниусу, - и это - сесть на пароход".