Гиксосский союз племен сформировался на Синайском полуострове ближе к концу XVIII в. до н. э. Основную его массу составляли кочевые племена западных семитов, однако в результате масштабных переселений народов, происходивших по всему Ближнему Востоку в предшествующие десятилетия, в него вошли и хурриты и даже небольшие группы индоевропейцев (индоариев). Последнее было очень важно потому, что именно индоевропейцы принесли на Ближний Восток навыки конного дела, — а лошадь и такой новый вид оружия, как боевые колесницы, появляются в Египте как раз с приходом гиксосов. В начале XVII в. до н. э. гиксосы подчинили себе земледельческие районы Южной Палестины (там их оплотом стала крепость Шарухен) и затем уже заселенную родственными им азиатами область Авариса; около 80-х годов XVII в. до н. э. они установили свою власть над всем Египтом (Манефон сообщает, что это произошло при их царе Салитисе).
Верховная власть гиксосских правителей получила оформление в полном соответствии с египетской традицией. Гиксосские цари, утвердившиеся в Аварисе, стали принимать египетскую титулатуру и в дальнейшем были включены в XV царскую династию. Она была признана не только на всей территории долины Нила, но и южнее, в Нубии (Куше), где после падения Среднего царства сложилось самостоятельное государство, объединившее весь этот регион, с центром в районе Кермы (третий порог Нила); оно также признавало вассальную зависимость от гиксосов. Кроме того, на пике своего могущества, во второй половине XVII в. до н. э., при царе Хиане, современником и приближенным которого арабская традиция считала знаменитого героя Библии Иосифа Прекрасного, гиксосы поставили в зависимость от себя мелкие государства Восточного Средиземноморья. Об этом, в частности, позволяет судить распространение скарабеев с именами гиксосских правителей.
Судя по всему, северным пределом сферы влияния гиксосов в регионе было верхнее течение Евфрата. Аварис, Восточная Дельта и район Синая и Южной Палестины, а также часть долины Нила в его среднем течении (до г. Кус на юге) подчинялись гиксосским царям напрямую; остальные территории находились под властью местных правителей, признававших себя их вассалами. Среди египетских богов гиксосы окружили особенным почитанием в Аварисе Сета, считавшегося покровителем чужеземных стран: в какой-то мере почитание этого бога врагами-чужеземцами содействовало его превращению со временем в наиболее мрачную фигуру египетской религии.
Вообще же гиксосское владычество впервые превратило Египет в подлинное средоточие внешних связей, протянувшихся не только по Восточному, но и по Центральному Средиземноморью. В это время гиксосы и египтяне соприкасаются с великой морской державой, созданной правителями Крита, а выходцы с острова Миноса селятся в Аварисе в особом квартале — в его постройках археологической экспедицией австрийского исследователя М. Битака обнаружены даже росписи со сценами тавромахии — типичного в сюжетах критского искусства ритуального боя с быком.
В Западной Дельте при гиксосах какое-то время, очевидно, влачила свое существование XIV династия; в Южном Египте на всем протяжении гиксосского владычества имели место другие самостоятельные образования. Центром самого сильного из них являлись Фивы, которыми владел дом правителей, по-видимому, ведущий преемственность непосредственно от одной из ветвей XIII династии. До некоторых пор все без исключения малые правители Египта признавали высшую сакральную царскую власть аварисских гиксосов (XV династия по Манефону).
Усиление Фив стало беспокоить гиксосских царей: согласно легенде, записанной спустя несколько веков, один из них — Апопи II Аакененра — отправил к фиванскому царю Секененра посольство с причудливым требованием унять нильских гиппопотамов, которые своим шумом близ Авариса якобы не давали гиксосскому царю заснуть. Конец этой истории не сохранился: похоже, по общим закономерностям такого рода фольклорных историй Секененра придумал какой-то находчивый ответ на «загадку» Апопи, и тот был вынужден оставить Фивы в покое. Однако состояние найденной археологами мумии Секененра, которая несет на себе следы тяжелых ранений, показывает, что он погиб насильственной смертью, возможно, в ходе войны с одним из преемников гиксоса — героя легенды царем Апопи III Ааусерра, правившим с середины 80-х годов XVI в. до н. э.
XVII династия
В 70-е годы XVI в. до н. э. Камос, сын Секененра от брака с дочерью правителя Гермополя Яххотеп, перестал признавать верховную власть гиксосского царя и сам принял царский титул. С него реально начинается XVII царская династия, хотя позднее Манефоном к ней были причислены и предшественники Камоса начиная еще с XVII в. до н. э.; при этом уже не признававшиеся сакральными царями правители Авариса были приписаны к так называемой XVI династии.