1525. — Первый суд над Максимом Греком
1526–1542. — Пребывание свт.[32]
архиепископа Макария на Новгородской кафедре. Успешная миссионерская деятельность в северных уездах, населённых финнами, где сохранялись остатки языческого культа. Макарий вводит общежительный устав в новгородских монастырях и разделяет монастыри на мужские и женские.1531. — Второй суд над Максимом Греком. Он признан виновным в намеренном искажении при переводе святых книг и сослан в Отрочь-монастырь. В мае — новый Собор для суда над старцем Вассианом Косым, обвиняемым в самовольном исправлении и искажении Кормчей Книги, а также в еретических рассуждениях. Вассиан осуждён и сослан в Волоколамский монастырь, где и скончался.
1533. — Преставление прп. Александра Свирского. Основание прп. Трифоном Печенгского Кольского монастыря.
1539. — Во время боярской смуты митрополита Даниила свергают с престола, ссылают в Волоколамский монастырь и заставляют отречься от митрополии. Избран и поставлен митрополитом игумен Троице-Сергиева монастыря Иоасаф (Скрыпицин).
1542. — Сторонники князя Ивана Шуйского ссылают митрополита Иоасафа в Кириллов монастырь. Митрополитом избран и поставлен архиепископ Новгородский свт. Макарий.
1547. — Собор в Москве, установивший для двенадцати святых праздники во всей отечественной Церкви и для девяти святых праздники местные. По благословению Собора Иоанн IV обращается ко всем святителям Русской земли с просьбой собрать сведения о новых русских чудотворцах.
1549. — Собор в Москве, канонизировавший новых русских чудотворцев. Установлено чествование всех известных русских святых, живших до первой половины XVI века (кроме тех, чествование которых было установлено ранее).
1551. — После окончания Собора Троицкий игумен Артемий и другие ходатайствуют перед Иваном Грозным за Максима Грека, находившегося в заточении в Тверском Отрочь-монастыре. Максим Грек переведён в Сергиеву Лавру, митрополит Макарий разрешает ему причастие Святых Христовых тайн. В том же году — Стоглавый Собор в Москве, подвергший пересмотру все стороны церковной жизни с целью исправления существующих недостатков. Составлен ряд исправительных предписаний относительно епархиального управления, епархиального суда, жизни высшего и низшего духовенства, монашества и мирян. Узаконено заведение училищ и распространение просвещения как в духовенстве, так и в народе. Подтверждено закрепление вотчин за монастырями. (Некоторые «ошибки» Стоглавого Собора были внесены в богослужебные книги и сделались главными началами для последующего церковного раскола.) Двуперстие для крёстного знамения утверждено в качестве догмата.
1552. — Свт. Макарий заканчивает составление «Великих Макариевских Четьих Миней», впервые собрав воедино всю имеющуюся на Руси церковную литературу. Также по его указаниям составлена «Сводная кормчая книга», объединяющая почти весь известный в Русской Церкви канонический материал, и «Никоновская летопись».
1553. — Устройство первой типографии в Москве, выпустившей анонимные издания.
1553–1554. — Церковный Собор в Москве осуждает еретиков протестантского толка Матвея Башкина и его приспешников и ссылает их в северные монастыри. Суд над белозёрским иноком ересиархом Феодосием Косым. Феодосий бежит в Литву, где развивает своё протестантствующее учение. Игумен Троице-Сергиева монастыря Артемий, также подвергнутый суду по этому делу, сослан в Соловки, откуда в дальнейшем бежит в Литву, где отстаивает православие в полемике с Феодосием Косым.
1555. — Преставление митрополита Иоасафа в Троице-Сергиевом монастыре. Учреждение Казанской епархии. Назначение её первым архиепископом св. Гурия, игумена Селижаровского. Заложение в Москве Покровского собора (церковь Василия Блаженного).
1558. — Обретение мощей епископа Новгородского св. Луки (Жидяты) и епископа Новгородского св. Никиты и перенесение их в Софийский собор.
1559. — Мурза Чюрак от лица всех черкесов просит Ивана Грозного крестить их в христианскую веру.
1561. — Соборный акт патриарха Константинопольского Иоасафа II, дающий Иоанну III право «быти и зватися царём законно и благочестиво». Этим актом Константинополь фактически ликвидировал свои прежние отлучения, наложенные на Русскую Церковь за поставление митрополита Ионы. Закончена работа над «Степенной книгой», составленной по указанию митрополита Макария.
1563. — Иоанн Грозный берёт Полоцк. Полоцкая епархия присоединяется к Московской митрополии. Преставление митрополита Макария.
1564. — Выходит в свет «Апостол», первая печатная книга в Московии. Выходит постановление впредь русским митрополитам носить белые клобуки с рясами и херувимами по примеру чудотворцев Петра и Алексия и запечатывать грамоты красным воском. Митрополитом избран инок Чудова монастыря Афанасий.