Махно, обозвав большевиков «политическими шарлатанами», заявил, что «распри Григорьева с большевиками из-за власти не могут нас заставить открыть фронт для кадетов и белогвардейцев». Махно не поддержал восстание, заняв выжидательную позицию. 18 мая махновская комиссия, посетившая район восстания, сообщила Махно о том, что григорьевцы громят и убивают евреев. После этого сообщения Махно издает воззвание «Кто такой Григорьев?», где называет атамана «разбойником», «контрреволюционером», «авантюристом», «провокатором-погромщиком». Махно был ярым противником антисемитизма и в своих частях расстреливал погромщиков. Отказался объединяться с Григорьевым и атаман повстанцев Чигиринского уезда Коцюр, да и атаман Зеленый не горел желанием подчиняться Григорьеву…
Во второй половине мая григорьевских повстанцев неожиданно быстро удалось разгромить и локализовать в степных районах Херсонщины. Многие части, поддержавшие Григорьева еще неделю назад, возвратились под красное командование. Григорьев обещал своим бойцам, что серьезного сопротивления они не встретят, заявляя, что вся страна уже захвачена повстанцами. Но когда григорьевцы Оказались под огнем пулеметов и пушек, боевой пыл их угас. Тысячи мятежников стали сдаваться при первом же Приближении частей Красной Армии. Силами трех красных войсковых групп удалось окружить район восстания.
19 мая группа Кременчугского направления под командованием П. Егорова выбила григорьевцев из Кременчуга, а Днепровская военная флотилия — из района Черкасс. С юга наступали части Дыбенко и Пархоменко. Соединившись с группой Егорова, они заняли Кривой Рог, станцию Долгонцово. 21 мая войска атамана были разбиты под Киевом. 22 мая стала красной Александрия, 23 мая — взята Знаменка, 26–31 мая части Одесского направления вытеснили Григорьева из Николаева, Очакова, Херсона. В боях второй половины мая григорьевцы понесли огромные потери: около 3 тысяч убитыми и более 5 тысяч пленными… Множество григорьевцев просто разбежалось по домам… В конце мая основные силы атамана, разбитые под Камянкой, скрываются в далеких степных селах и переходят к тактике партизанской войны. Ю. Тютюнник с 2 тысячами восставших (Повстанческий кош) оторвался от главных сил Григорьева и, выйдя к местечку Шпола, увел свой отряд на соединение с силами Петлюры.
В начале июня 1919 года командование Красной Армии решило, что с григорьевщиной и зеленовщиной полностью покончено и непосредственная опасность потерять власть миновала. Войска красных были переброшены против Деникина и объявленного вне закона Махно.
Из 20 тысяч повстанцев у атамана Григорьева осталось 3 тысячи, еще около 2 тысяч повстанцев ушли к различным мелким местным атаманам. Григорьев временно признает над собой идейное руководство воюющего против диктатуры большевиков Повстанческого ревкома левых украинских социалистов (во главе с Ю. Мазуренко). Он был признан этим ревкомом командиром одной из дивизий повстанцев. В трех других дивизиях (атаманов Тютюнника, Мазуренко, Дьяченко) насчитывалось до 10 тысяч повстанцев. Эти дивизии совершали налеты на Фастов, Сквиру, Белую Церковь. Отряд Григорьева делал набеги на Александрию, перерезав основные железнодорожные пути с юга Украины на север. Нападая на эшелоны, которые шли из Крыма и Причерноморья, григорьевцы захватили огромное количество ценностей и военного имущества. В это время крестьяне разрушали железные дороги, скручивая рельсы в клубок с помощью упряжек волов. Целые районы промышляли грабежом не только военных эшелонов, но и пассажирских поездов. Это было началом войны деревни против города.
В июне 1919 года Григорьев уже не был самым влиятельным украинским атаманом. Украина распалась на сотни полностью независимых сельских атаманий — районов, в которых признавалась власть только своего атамана, и больше никого. В районе Сквиры атаман Несмеянов, бывший красный комбриг, создал анархистскую «Группу войск, восставших против коммуны», район Глухова контролировали местные «анархисты». Атаман Евгений Ангел организовал «Рыцарское казачество Левобережья», нападая на Конотоп и Нежин. На Екатеринославщине появились независимые атаманы Мелашко, Гладченко, Брова, Живодер. После расстрела красного комбрига Богунского (за отказ воевать против Зеленого) его бригада восстала, выбив большевиков из Золотоноши. Наиболее надежные красные части — Таращанский полк Боженко и конный полк Гребенки — высказывали недоверие коммунистам и ЧК и собирались «идти на Киев».
В Приднепровье собрались атаманы Чайковский, Орлик, Сагайдачный… которые, пользуясь полным хаосом в тылу Красной Армии, захватывали и некоторое время удерживали города Берислав, Каховку, Никополь, станцию Явлинская. В июне 1919 года разгорелось восстание в Холодном Яру у Чигирина. Восставшими командовал кубанский есаул атаман Уваров (1,5 тысячи бойцов, 24 пулемета, 2 орудия)