В последних числах июня 1962 года после интенсивных занятий на центрифуге при повышенной перегрузке медики обнаружили у Георгия Шонина сбои в кардиограмме. 4 июля 1962 года его тоже, как и ранее Григория Нелюбова, отстранили от подготовки к предстоящему групповому полету космических кораблей. Дублером Павла Поповича стал Владимир Комаров. Готовившаяся к групповому полету «семерка» превратилась в «пятерку».
Медицина всерьез взялась за Георгия Шонина. Его, наверное, в итоге отчислили бы из космического отряда, но к счастью медицинское «дело» кандидата в космонавты, в конце концов, попало на рассмотрение главного терапевта Советской Армии генерал-лейтенанта Молчанова. Он внимательно выслушал рассказ Георгия Шонина о том, когда и после чего проявились сбои в его кардиограмме, полистал папку с результатами медицинского обследования, лично послушал сердце молодого пилота. А потом повернулся к сопровождавшим Георгия на осмотр медикам из ЦПК ВВС и сказал:
- Перестаньте мучить парня! Он просто перетренировался. Лучше отправьте его на месяц куда-нибудь отдохнуть.
Вроде бы непосредственная угроза отчисления из отряда космонавтов для Георгия Шонина миновала. Но в состав «семерки» его так и не вернули. Более того, несмотря на «оправдательный вердикт» генерал-лейтенанта Молчанова, в конце июля 1962 года в руководстве Центра подготовки космонавтов опять начал
муссироваться вопрос об отчислении «больного» Шонина из отряда космонавтов. На защиту Георгия Шонина стал кандидат на ближайший космический полет и парторг отряда Павел Попович. Он обратился в вышестоящую партийную организацию с заявлением, в котором в связи со своей большой загруженностью по подготовке космического полета на корабле «Восток–4» просил разрешения передать свои партийные обязанности Георгию Шонину.«Так вышло, что даже «комиссарские» дела, в связи с занятостью по подготовке к своему первому полету в космос, - вспоминал позднее Павел Попович, - я передал Георгию, который затем на протяжении пяти лет возглавлял партийную организацию отряда».
Решение Павла Поповича оказалось точным и верным: новоизбранного партийного секретаря отчислять из отряда космонавтов никто уже не решился.