Обучение начиналось с изучения теоретических дисциплин, посвященных всем аспектом службы на подводных кораблях, кораблестроению, вооружению, дизельным и электрическим силовым установкам, кроме того кадеты изначально учились отрабатывать действия в различных аварийных ситуациях.
В 1935 г. была сформирована Unterseebootsflotille 1 Weddigen в составе подводных лодок U-7 — U-12 (субмарины U-l — U-6 являлись учебными и были приписаны у учебному центру подводных сил в Нейштадте). Лодки U-7 — U-12 являлись небольшими прибрежными кораблями II серии, которые получили в среде подводников прозвище «байдарки».
С момента формирования 1-й флотилии кадеты получили возможность дополнить скучное изучение теории в классах веселыми практическими походами на субмаринах. U-ботфаффе росло стремительно, поэтому в 1937 г. в Нейштадте создали еще один учебный центр подплава, известный как Unterseebootsschule. К 1939 г. численность Unterseebootsschule возросла вдвое, после чего заведение получило статус дивизии — Unterseebootslehrdivision (ULD) — и было переведено на Балтику в порт Пиллау. Еще через семь месяцев в Готенхафене была сформирована 2-я учебная дивизия, 2 ULD. Одновременно одна дивизия готовила порядка 4000 курсантов. К учебной дивизии была приписана полноценная флотилия подводных лодок, к 1 — й учебной дивизии — 21 Unterseebootcflotille, ко 2-й учебной дивизии — 22 Unterseebootcflotille.
В начале войны, по крайне мере, курс подготовки подводника занимал шесть месяцев, это — не считая предварительной общефлотской подготовки. По ходу войны время обучения постоянно сокращалось, в конечном итоге длительность курса была уменьшена всего до двух месяцев. Однако, два месяца тоже посчитали слишком большим сроком. Известно немало случаев, когда подводники вообще не получали специальной подготовки.
Подготовка старшин
Еще в конце Первой мировой войны выявилась необходимость углубленной подготовки старшинского состава и более тщательного отбора кандидатов в старшины. Со временем старшины стали профессиональными военными, которые подписывали контракт на 12 лет службы, в то время как ранее старшин готовили из матросов-призывников. Кандидатов в старшины по-прежнему отбирали из матросов, прослуживших по два — три года, однако в запас по истечении срока матросской службы уже не увольняли. Добровольцев в старшины на «гражданке» не вербовали принципиально. Отобранные матросы проходили дополнительную подготовку сроком от трех до десяти месяцев в школах младших военно-морских командиров. Затем их направляли в учебный центр старшинского состава, дислоцированный во Фридриххорсте.