Стандартной системы управления ассоциацией, холдинговой компанией, ФПГ не существует. В зависимости от доли участия в уставном капитале объединенных в сообществе предприятий, степени их диверсификации и географического размещения управление холдинговой компанией или ФПГ может осуществляться по принципу предприятия, т. е. в режиме жесткой подчиненности центру.
Чаще используется форма ассоциативного управления, но без права свободного выхода субъектов из системы холдинга. Иногда используется смешанная форма.
При организации предпринимательских союзов и обществ необходимо: соблюдать определенные правила и использовать отечественный и зарубежный опыт; привлекать к их управлению специалистов, менеджеров, экономистов, юристов.