Эпигенетика

^b Номенклатурное обозначение начинается (слева направо) с гистона, затем пишется остаток, затем — модификация. В тех случаях, где модифицированный остаток не известен или не важен, модификация должна следовать за гистоном, например: Н4ас и Н2Ваг1. Множественные модификации можно обозначать, просто расширяя список (например, H3K4me 3K9ac S10ph ...) по мере необходимости. Поскольку каждый отдельный модифицированный остаток начинается с прописной буквы, обозначающей аминокислоту, и поскольку сами модификации все обозначаются строчными буквами, нет необходимости в использовании запятых или точек, чтобы разделять отдельные модифицированные остатки в «слове», обозначающем комбинацию остатков; в этом случае остаток следует вставлять без добавлений (например, H3K9S10ph, чтобы указать H3, не модифицированный по Lys-9 и фосфорилированный по Ser-10).

^c Полиубиквитилированные гистоны обозначаются ubn.

^d В настоящее время гипотетично.

С изменениями и с любезного разрешения из: Turner В.М., Nat. Struct. Mol. Biol. 12: 110-112. (2005).

Эпигенетические механизмы, действующие у разных модельных организмов

Сокращение: (Hs) — Homo sapiens.

^a Эпигенетическая особенность считается имеющейся на основе гомологии последовательностей, но не функциональных данных.

^б Имеются данные, что метилирование H3K9 обнаруживается в районах активного хроматина; однако функциональное значение этого не известно.

^в Триметилирование H4K20 у S. cerevisiae отсутствует, тогда как у многоклеточных организмов имеются все три состояния метилирования H4K20.

^г У Drosophila уровни метилирования ДНК очень низкие.

^д Мутантный Dnmt2.

^е Dnmt2 (Рр) и MBD-доменные белки (Се, Cb, Рр).

^ж Dnmt2 и MBD-доменные белки (Dm).

^з Хромосомный или геномный, а не ген-специфичный.