Когда разразились варп-штормы и человечество вступило в свой жуткий период изоляции, Марс постигла та же судьба, что и другие миры людей. Красная планета оказалась отрезана от своих колоний, ее рабы-навигаторы больше не могли прокладывать надежный курс через варп, и Марс оказался затерян внутри Солнечной системы, погружаясь в гражданскую войну между сокращающимися сообществами, анархию и кровопролитие. Марс пострадал так же, как и Древняя Земля, а в некоторых моментах даже сильнее, не имея достаточно еды и воды для населения, за чем быстро последовал голод и война, затем стало еще хуже, когда из-за повреждений и запущенности планетарные противорадиационные щиты и макроиндустриальные фабрики пришли в негодность и отравили планету еще сильнее, убивая хрупкую искусственную экосистему, поддерживаемую тысячелетиями. К тому времени, когда Механикум поднялся из своих подземных убежищ, чтобы вырвать власть из рук разрозненных каннибалов, мутировавших от радиации тварей, полубезумных автоматов и заблудших душ, обитавших на погрузившейся во тьму поверхности, из культа, посвященного выживанию путем возвращения технологий, он развился в полноценное техномистическое вероучение. Под контролем крупных феодалов-техножрецов Механикума порядок был восстановлен, радиационные щиты отремонтированы и возведены великие машинные храмы, откуда потекли материалы и оборудование, синтетическая еда и кислород, и Марс был перестроен по подобию их нечеловеческого бога-конструкта.
Задолго до того, как Император воссоединил Терру под своим знаменем, Марс уже жил как единое целое под эгидой Омниссии, и когда марсиане осмотрели Солнечную систему и отправили корабли к ее орбитам, то нашли лишь хаос, опасность и дикость. Они сосредоточили свое внимание на Старой Земле, древнем оплоте мощи человечества, глядя на нее одновременно с жадностью и страхом. Они знали, что этот мир прячет множество тайн, и что воюющие варвары Древней Земли могут собрать их и воспользоваться ими, возможно, однажды со всей своей свирепостью обрушившись на Марс. И так получилось, что техножрецы стали злейшими врагами техноварварских племен и сменяющейся касты кровавых тиранов, что держали власть над частью Старой Земли. Сотни лет они старались отнять или украсть любые технологии, какие можно, но кроме того их всерьез занимала судьба остальной части человеческой Галактики. Чтобы выяснить это, они периодически отправляли в варп огромные корабли в надежде найти какие-то подсказки, а также колонизировать и восстановить те владения человечества, какие еще возможно. Это были первые эксплораторские флоты Марса, и за века сотни таких экспедиций вслепую отправились к мрачным звездам, в жертву бурлящему варпу. Некоторые основали новые колонии, которые станут мирами-кузницами к моменту воссоединения с забытой родней при экспансии Империума, но многие просто пропали.
Когда Император объединял Терру, хозяева Марса пристально и ревниво следили за разворачивающимися событиями, при этом некоторые разглядели в нем родственную душу — Император был для них человеком науки, ценящим машины и технический прогресс, однако другие видели в нем лишь новую беспощадную силу, которой следует опасаться. Когда на Марс просочились слухи о сверхчеловеческих достижениях Императора, некоторые техножрецы даже начали равнять его с своим Богом-Машиной, считая это исполнением древних пророчеств. На Марсе вспыхнули споры: считать Императора спасителем или врагом. Однако, всё это происходило не без ведома самого Императора, ибо он также следил издали за Красной планетой и готовил свои планы.