Но по мере распространения контроля отрядов ФАРК-ЕП на всё большую территорию, где крестьяне занимались выращиванием коки (единственного прибыльного в условиях Колумбии растения), руководство ФАРК было вынуждено выработать собственную стратегию по отношению к производству наркотиков. Стратегия эта свелась к следующему: на контролируемых территориях партизаны не преследуют крестьян, выращивающих коку, поскольку крестьянство – это социальная база герильи и ФАРК обязалась защищать социальные интересы крестьян. Одновременно партизаны уничтожают плантации коки и заводы по ее переработке, принадлежащие наркобаронам, уничтожают самих представителей наркомафии, а конфискованные у них земли передают крестьянам, не вмешиваясь в вопрос, какие культуры на этих землях крестьяне будут выращивать (эта политика привела к тому, что наркокартели стали злейшими врагами партизан и создали для борьбы с ними «эскадроны смерти», известные как «парамилитарес»). Крестьянские хозяйства, выращивающие коку и перерабатывающие ее на «домашних заводах», облагаются ФАРК специальным «революционным налогом». Таким же налогом облагаются и курьеры, доставляющие продукты переработки из зоны контроля ФАРК вовне. На территориях, контролируемых ФАРК, наркоторговля запрещена и карается смертью; употребление алкоголя и наркотиков наказывается принудительными общественными работами. «Революционный налог» на наркотики является сегодня одним из основных источников финансирования деятельности ФАРК.
В марте 2000 года ФАРК обратилась с «открытым письмом» к «Конгрессу и народу США» с предложением решить проблему наркотиков в Колумбии, которая так волнует власти в Вашингтоне. В письме указывалось, что именно США являются основным потребителем колумбийских наркотиков, а, по законам рынка, спрос рождает предложение. Чтобы ликвидировать наркопроизводство в Колумбии, руководство ФАРК предложило легализовать наркотики в США (что резко снизит их стоимость) и, следовательно, разрешить посев наркосодержащих культур непосредственно в Соединенных Штатах, после чего производство наркотиков в Колумбии станет абсолютно нерентабельным. Власти США не откликнулись на это письмо. В июне 2000 года руководство ФАРК обратилось к правительству Колумбии с тщательно разработанным проектом замены выращивания наркосодержащих растений другими видами сельскохозяйственной продукции, что возможно только при субсидировании государством обычных агрикультур, чтобы сделать их производство рентабельным. Правительство Колумбии не отреагировало на этот план.
Зато скандалы, связанные с вовлечением колумбийского правительства, армии, спецслужб и крайне правых «эскадронов смерти» в наркобизнес, начались еще в 80-е годы – и с тех пор все учащались. Еще в 1984 году стало известно, что одна из двух основных группировок «эскадронов смерти», из которых позднее (в апреле 1997 года) армия сформировала крупнейшее объединение «парамилитарес» «Объединенные силы самообороны Колумбии» (АУК) – группировка «Смерть похитителям», – была создана наркобаронами из клана Очоа. О том, что вторая основная группировка – «Магдаленская бригада» (или МОРЕНА) – была создана совместно 14-й бригадой колумбийской армии и Медельинским картелем, стало известно только в 2003 году, когда «Магдаленской бригады» уже давно не было.
«Эскадроны смерти» (в первую очередь АУК) ответственны за 80 % политических убийств в Колумбии. В результате применяемой ими тактики «выжженной земли» свыше 2,5 млн человек стали внутренними беженцами. Многие из них ушли на юг страны, где расчистили участки сельвы и занялись выращиванием коки. Сведения о прямой причастности АУК к наркобизнесу были так многочисленны, что в 1991 году США вынуждены были внести АУК в список террористических организаций. Это, однако, не помешало ЦРУ в 1999 году выделить колумбийской армии вертолеты специально для спасения лидера АУК Карлоса Кастаньи, когда того осадили в его тайном убежище партизаны ФАРК.
Большой скандал разразился в Колумбии в августе 1989 года, когда выяснилось, что несколько тысяч политиков и государственных чиновников разного уровня находятся на содержании Медельинского картеля. Президент Вирхилио Барко издал специальный указ о смещении со своих должностей продажных государственных чиновников и об увольнении из рядов полиции свыше 2 тыс. офицеров, купленных Медельинским картелем. Не меньший скандал вызвало позже решение следующего колумбийского президента – Сесара Гавильи – об отмене этого указа В. Барко.