Основные процессы гидролиза и транспорта у высокоорганизованных животных и человека, а также у ряда беспозвоночных реализуются в кишечнике. В связи с этим рассмотрим особенности структуры пищеварительных ферментов апикальной мембраны кишечных клеток млекопитающих, которые осуществляют заключительные этапы гидролиза основных групп пищевых веществ. При этом возможна прямая экстраполяция характеристик кишечных мембранных ферментов теплокровных организмов на характеристики ферментов более низкоорганизованных животных, так как строение мембраны и ферментативно активных белков, встроенных в фосфолипидный матрикс мембраны, практически универсально.
Большинство кишечных ферментов является трансмембранными интегральными белками (точнее, гликопротеинами) с большой молекулярной массой. Так, молекулярная масса кишечной щелочной фосфатазы — около 120 000—130 000 дальтон, аминопептидазы — варьирует от 225 000 до 280 000 в зависимости от вида животного, карбогидраз, в том числе сахаразно-изомальтазного комплекса, более 200 000. Однако некоторые ферменты, например дипептидаэы апикальной мембраны кишечных клеток, могут быть периферическими интегральными белками, т.е. лишь частично включенными в фосфолипидный бислой мембраны, о чем можно судить по их спонтанной солюбилизации (рис. 1). По-видимому, в естественных условиях мембранные ферменты существуют в виде олигомеров, примером чему служит сахаразно-изомальтазный комплекс.
Часть фермента может выступать над поверхностью трехслойной мембраны примерно на 10—15 нм. Простетическая группа молекулы фермента — олигосахаридная цепь (цепи) занимает наружное положение по отношению к мембране и выдается в полость тонкой кишки, возможно, принимая участие в формировании структур гликокаликса, рецепции биологически активных веществ и связывании субстратов (рис. 2).