Осенью 1940 года Народно-освободительная армия Китая (НОАК) впервые провела успешное наступление против японцев – «поход ста полков». Потери японских войск достигли 26 тыс. убитых и раненых. Однако вскоре в результате нападения гоминьдановцев на коммунистическую 4-ю армию в Аньхое сторонники Мао потеряли 9 тыс. человек. В дальнейшем под давлением СССР, а потом и США Чан Кайши и Мао Цзэдун продолжили совместную борьбу с Японией. К тому времени Мао располагал армией в полмиллиона человек. У Чан Кайши под ружьем было более миллиона бойцов. Однако лишь малая часть и коммунистов, и гоминьдановцев сражалась против японских войск, преимущественно партизанскими методами. Основные силы оба соперника сохраняли для последующей борьбы за власть, и стычки между подразделениями их армий были по-прежнему нередким явлением, поскольку обе стороны хотели занять как можно большую территорию в сельской местности, где не было японцев. А легче сделать это было за счет друг друга, а не японцев. К концу 1944 года у Мао была 700-тысячная армия, контролировавшая провинции с населением 90 миллионов человек, а у Чан Кайши – армия в полтора миллиона человек, удерживавшая провинции с населением 200 миллионов человек. В обоих случаях это были те провинции, в оккупации которых японцы не были особенно заинтересованы. Между тем в китайской Красной армии в период с осени 1942 года по лето 1943 года прошли широкомасштабные чистки. Под видом «гоминьдановских и японских агентов» устранялись все те, кто мог составить оппозицию Мао Цзэдуну. Всего было выявлено более тысячи таких агентов, и более половины из них признали свою вину. Из компартии Китая было исключено 40 тыс. из 200 тыс. членов.
В целом, однако, исход войны на Тихоокеанском театре боевых действий решался в морских сражениях американского и японского флотов, так что партизаны, действовавшие на суше, никакого влияния на него в принципе оказать не могли, а морских партизан, в отличие от голландских гезов XVI века, в Азии в годы Второй мировой войны не было. Существовали только морские пираты, но с японцами они не воевали, довольствуясь в качестве добычи местными джонками в малайских и филиппинских водах. Наибольшее значение имели действия партизан в Южном Китае, взаимодействовавших с остатками регулярных войск Чан Кайши. Однако сам этот театр был сугубо второстепенным.
Помимо Китая, отряды антияпонских партизан действовали в Корее, Индокитае, Бирме, Малайе, Индонезии и на Филиппинах. В Индонезии, Индокитае и на Филиппинах среди партизан было сильно влияние коммунистов, но нигде, кроме Вьетнама, они не преобладали. Кроме Китая, наибольшего размаха партизанское движение достигло на Филиппинах, где партизаны взаимодействовали в 1944–1945 годах с высадившимися на островах американскими войсками. По некоторым оценкам, погибло около 20 тыс. филиппинских партизан. Скорее всего, в это число входят также заложники, расстрелянные японцами в ответ на действия повстанцев.
Японцам, в отличие от немцев, после вступления во Вторую мировую войну не приходилось проводить крупных антипартизанских операций с привлечением нескольких дивизий регулярной армии. С китайскими партизанами, в частности, вели борьбу солдаты армии созданного Японией марионеточного государства Маньчжоу-Го и прояпонского марионеточного правительства Китая в Нанкине во главе с Ван Цзин-веем.