Перед Великой Отечественной войной первые три предложения были приняты, последнее же не нашло положительного решения. В Военно-медицинской академии были организованы санитарный полигон и учебный медсанбат. Нерешенным остался вопрос о подготовке руководящего состава медицинской службы. В ходе войны нашло решение и наше предложение о поддержании на должном санитарно-гигиеническом уровне полей сражения, для чего были организованы команды по захоронению погибших. Были поддержаны предложения о сокращении врачебных должностей в батальонах и полках, о структуре и об увеличении штатной численности медсанбатов дивизий и ППГ. Остались нереализованными предложения об увеличении штатной численности ротных санитаров и санитарных инструкторов. Предложение об автохирургических отрядах хотя и было принято, но мы были вынуждены в начале войны изменить свою точку зрения. Врачей-хирургов не хватало. Это предложение не опиралось на фактические возможности и было нереальным.
После разгрома фашистской Германией англо-французских войск и окончания советско-финляндской войны в 1940 году в Красной Армии началось углубленное изучение опыта боев и развития военного искусства, и на этой основе осуществлялась организационная перестройка Вооруженных Сил СССР. Военно-санитарное управление также стало форсировать решение организационных вопросов и разработку ряда наставлений, инструкций и указаний по медицинской службе. Разработка, как правило, велась в комиссиях. Дискуссии между членами комиссий помогали избегать грубых ошибок и упущений.
Перечень наставлений, указаний и инструкций, подлежавших разработке, был весьма разнообразен по содержанию, отличался своей специфичностью, требовавшей специальных знаний и времени для изучения.
Успех лечения раненых и больных на различных этапах эвакуации, кроме правильного решения структуры медицинских учреждений, их профиля, подчиненности и подвижности, зависит от того, насколько строго будут соблюдаться преемственность в лечении и систематически совершенствоваться методы и средства лечения. Но для этого требуется институт главных специалистов в центре, во фронтах, армиях и в эвакопунктах, а также хорошо разработанные формы персонального учета раненых и больных и статистической отчетности об их движении и исходах лечения. Был предусмотрен институт главных специалистов в действующей армии. Формы документации были разработаны с учетом опыта военных столкновений 1939–1940 годов и введены в действие приказом наркома обороны 21 мая 1941 года. Все медицинские учреждения обеспечивались бланками учета и отчетности централизованно.
Обеспечить хирурга пособием карманного формата было нашим общим желанней, которое разделялось всеми членами ученого совета при начальнике управления и ведущими хирургами Военно-медицинской академии. Николай Нилович Бурденко, работавший в ВСУ нештатным консультантом-хирургом, хотел сделать это пособие по образцу «Инструкций по неотложной хирургии», которые были составлены при участии Всесоюзной ассоциации хирургов, ученого медицинского совета Наркомздрава СССР и ВСУ и изданы в феврале 1940 года. Цель этих документов сводилась к ознакомлению врачей больничных и амбулаторно-поликлинических учреждений с некоторыми особенностями работы в полевой медицинской службе. Так как Н. Н. Бурденко относился к числу людей, которые не склонны легко отказываться от своих убеждений, мне пришлось потратить много времени и привести многочисленные доводы, чтобы обосновать необходимость подготовки двух пособий для хирургов, работающих в учреждениях полевой медицинской службы и тыловых госпиталях. В числе доводов были не только специфические особенности, отличающие неотложную хирургию от военно-полевой, но и условия, в которых последняя применяется. Николай Нилович не столько недооценивал, сколько не придавал принципиального значения важнейшим особенностям военно-полевой хирургии, являвшимся главным содержанием подготовки хирургов к работе в полевых условиях и к повседневной практической деятельности. Особенности эти таковы.
Прежде всего это касается объема и характера медицинской помощи в полевых учреждениях войскового и армейского тыловых районов. Они определяются не столько медицинскими показаниями, сколько боевой и медико-санитарной обстановкой.
Организация работы лечебных учреждений полевой медицинской службы совершенно иная, нежели в эвакогоспиталях фронтового тылового района и особенно тыла страны. Прием, сортировка и хирургическая обработка большого количества раненых составляют главную особенность работы полевых учреждений. Она предъявляет специальные требования к подготовке хирургов и их расстановке в медицинских учреждениях.
Еще одна особенность заключалась в том, что боевые санитарные потери по месту, времени и числу, разнообразию и тяжести повреждений, особенностям течения и проценту осложнений составляют специфику работы хирургов полевой медицинской службы.