В конце 1971 года Высший нормативный совет, используя свои права, предоставленные ему статьей 38 университетского устава, разделил управление университетом в столице на 4 зоны, названные Северной, Южной, Восточной и Западной. Это деление отражало расстановку различных противоборствующих политических сил и их равновесие. Меньшинство совета и Боэннингер выступили против этих изменений.
В январе 1972 года в конфликт вмешался президент Альенде. На совещании, проходившем в его частной резиденции на Томаса Моро, решили провести новые выборы после того, как Боэннингер подаст в отставку. Выборы были назначены на 4 апреля 1972 года.
Боэннингер, естественно, вновь был выдвинут кандидатом от правых. А левые силы оказались разрозненными. Народное единство выставило в качестве кандидата Фелипе Эрреру, который был председателем Межамериканского банка развития, орудия империалистического проникновения в Латинскую Америку. Причина, по которой выдвигался такой кандидат, состояла в том, что при существующем социальном составе студентов и преподавателей нельзя было победить на выборах, выставив кандидатом человека радикальных, революционных взглядов. Надо было выставить умеренного кандидата, который устраивал бы средние слои, которые составляли в университете большинство.
Часть левых считала, что кандидатура Эрреры внесет замешательство в ряды студентов, активно участвовавших в деятельности Народного единства или симпатизировавших ему. Они не видели большой разницы между Эррерой и Боэннингером и подчеркивали, что соглашательство с правыми приведет к ослаблению левых сил. Левое революционное движение (МИР) выдвинуло в качестве кандидата Андреса Паскаля. Так называемая Революционная армия представила в качестве кандидата Луиса Витале. Партии Народного единства поддержали кандидатуру Эрреры.
Выборы принесли победу Боэннингеру – 51,86 % голосов, Эррера получил 43,53, Паскаль – 3,66, а Витале – 0,85 %. Результаты голосования отражали классовый состав университета, на протяжении десятков лет пополняемого представителями средних слоев буржуазии. Дети рабочих имели туда совсем незначительный доступ. Из этих цифр также следует, что широкие слои прогрессивной или радикальной мелкой буржуазии набирали силу, но еще не добились в университете большинства.
Разделение на четыре зоны управления еще сохранялось. Восточная зона с ее 16 тыс. студентов и 13 факультетами была самой крупной и полностью оставалась в руках левых сил. Из 13 деканов 7 были социалистами и 6–коммунистами. Несколько месяцев спустя вице-ректор социалист Эдуарде Руис заявил, что Боэннингер постепенно душит эту часть университета, сокращая ее бюджет.
Например, Восточная зона с ее 42 % всего состава студентов в столице получила 42 млн. эскудо, тогда как Южная, контролируемая правыми, насчитывавшая 7,7 % всего состава студентов, получила 32 млн. Диспропорция была явной.
Этой и другими мерами Боэннингер переводил Чилийский университет на позиции, враждебные Народному правительству, и мешал той помощи, которую университет, располагающий большим количеством высокообразованных кадров, мог бы оказать процессу социальных преобразований.
Еще одним из идеологических инструментов, с помощью которого чилийская буржуазия вела бой с Народным единством, стала система образования.
Во времена президентства Фрея была предпринята попытка провести в Чили реформу системы образования с целью усиления ее технократического характера с учетом слабой развитости страны, однако и она далеко не решала действительных проблем образования.
В первые два года правительства Народного единства архаичная система образования оставалась без изменений. Число учащихся в школе возросло на 34,5 %. Это было одно из конкретных достижений Народного правительства. Кроме того, на 100 % увеличилось количество выдаваемых школьных завтраков и обедов и намечался рост строительства школьных зданий по всей стране. Осуществлялся план распределения молока в школах.
Но не была решена коренная проблема дела образования – приспособление старой системы воспитания к потребностям дня.
Два министра просвещения Народного единства – Марио Асторга и Алехандро Рисе Вальдивия – на себе испытали результаты школьных беспорядков, организованных Федерацией учащихся средних школ и техникумов, руководимой членом Демохристианской партии Гильермо Юнге. Последний даже заявил в интервью журналу «Эрсилья» (№ 1942), что учащиеся являются общественной силой, которую можно сравнить с рабочими и крестьянами. По его словам, организация школьников по своей значимости – это среднее командное звено после правительства, конгресса и политических партий. Необходимо, говорил Юнге, с помощью этой силы выковать студенческую власть. Юнге хвастался, что он заставил подать в отставку 2 министров и угрожал свергнуть тогдашнего министра просвещения Анибала Пальму.