В 1912 г. Колчак служит на кораблях Балтийского флота: командовал эсминцами и миноносцами. Здесь застает его первая мировая война. Капитан 1-го ранга Колчак топил германские суда, следовавшие с рудой из Швеции в Германию, одно время возглавлял группу заградителей, расставивших у Даннинга сотни мин. от которых германский флот понес серьезные потери. В 1915 г. Колчак, исполняя временно обязанности командира минной дивизии, на практике осуществил разработанную им тактику морского десанта. За успешное выполнение боевых заданий Колчак был представлен к ордену святого Георгия IV степени.
В апреле 1916 г. Колчак становится контр-адмиралом, а 21 июня назначается командующим Черноморским флотом. С этим назначением ему присваивается воинское звание вице-адмирала. На новую должность его напутствовал император Николай 11. Новый командующий Черноморским флотом перед отправкой к месту службы нанес визит в Ставку - генералу М.В.Алексееву и получил от него инструктаж но общему политическому положению. Были обсуждены и задачи, стоявшие перед флотом на тог период.
Русские морские силы Черноморского флота в 1916 г. имели в своем составе 7 линейных кораблей, 3 крейсера, 22 эскадронных миноносцев. 12 подводных лодок.
Перед Колчаком Ставка поставила сложную задачу: мощным ударом но Константинополю попытаться вывести из войны Турцию. Из данной директивы Колчак выделил важное направление к се осуществлению. Он приходит к убеждению, что прежде всего необходимо перекрыть доступ юрманеким крейсерам и подводным лодкам в Черное море. Это становится важнейшей стратегической задачей флота. Решить ее можно было лишь блокадой анатолийских коммуникаций и пролива Босфор. С! этой целью в горле Босфора Колчак ставит отдельные мины, а при выходе из него -минные поля.. Было поставлено 820 мин, а к осени 19,16 г. Черноморский флот произвел у Босфора 17 минных постановок - 4000 мин различных образцов. В итоге германское командование перестало посылать в Черное море свой подводный флаг. Первая часта, задачи, поставленной Ставкой, была в основном выполнена, хотя отдельные суда противника прорывались. но против них использовались подводные лодки Черноморского флота.
Черноморский флот оказывал содействие и войскам Кавказского фронта в наступательных операциях - обеспечивал доставку подкреплений Кавказской армии. Судами флота было перевезено из Новороссийска и
о л
Мариуполя около 60 тысяч солдат и офицеров, большое количество оружия и снаряжения. Две дивизии войск было переброшено в Трлпезунд. «Во время перевозок, - отмечается в коллективном труде «История первой мировой войны». - русские не понесли потерь ни в кораблях, ни в транспортах. ни в людях. Перевозки были осуществлены в точно установленные сроки. Организация и обеспечение перевозок войск, принятые на Черном море в 1916 г., считаются наиболее совершенными в первую мировую Bovins'».
Во второй половине ноября 1916 г. Колчак начинает подготовку «большой босфорской операции». Его проект получил одобрение Ставки. В распоряжение Колчака Ставка выделила дивизию «ударного типа», состоявшую в основном из фронтовиков. Эта дивизия предназначалась в первый ошело.н десанта на турецкий берег. За нею, для развития успеха, предполагалось бросить в бой 3-4 стрелковых корпуса. Однако неудачи на Румынском и Юго-Западном фронтах не позволили найти необходимые войска для операции.
Ставка принимает решение перенести операцию на поздние сроки, ограничившись лишь высадкой десанта в районе Синопа. Десант, взяв Синоп. должен был дезорганизовать тыл неприятельской армии. Но и десант не был высажен. Свержение Временного правительства похоронило и все его военные планы.
Когда Колчак получил телеграмму о переходе власти в Петрограде к Временному правительству, он приказал до выяснения положения в стране прекратить всякое сношение Крыма с остальной Россией. Войну, как он считал, надо доводит ь до победного конца - это должно быть «самым главным и самым важным делом, стоящим выше всего - и образа правления, и политических соображении». Колчак первым из командующих флотами присягну л Временному правительству, организовав 5 марта 1917 г. молебен и парад по случаю победы революции.
В то время учрежденный Центральный исполнительный комитет Совета депутатов флота, армии и рабочих морских частей подчинялся командующему флотом. Первые разногласия с Советом произошли из-за отказа команды одного из миноносцев выйти в морс и требования команды дру гого судна сменить командира. Колчак на уступки нс пошел. Тогда ■матросы обвинили его в том, что он «преднамеренно тормозит революционные преобразования на флоте». Последовали аресты офицеров. Подчиняясь матросам. Колчак сдал оружие и выехал в столицу по вызову Керенского. Так закончилась служба Колчака на флоте. Больше на флот он не вернулся.