В некоторых районах с большим речным стоком у Гвинейского побережья создаются обширные области сильного опреснения, резко различные по своим экологическим условиям: с одной стороны — прибрежные опресненные мутные воды, с другой — прозрачные воды океана. В первых почти нет хищников, там происходит нерест некоторых рыб. Во вторых общее число видов больше, много и хищных рыб.
В западной части экваториального пояса в океан впадает величайшая по водоносности река мира Амазонка. На расстоянии нескольких десятков миль от ее устья на поверхности океана обычно отмечаются плавающие на более плотных водах «линзы» опресненной (приблизительно до 310
/00) воды. Гвианское течение (продолжение северной ветви Южного пассатного) постепенно относит их дальше на северо-запад. Речной сток усиливает стратификацию вод близ устья Амазонки и затрудняет вертикальное перемешивание. В результате общая биологическая продуктивность прибрежных вод иногда уменьшается, несмотря на присутствие в речных водах питательных веществ. Из-за низкой прозрачности вод близ устья фотосинтез часто идет лишь в верхнем 10-метровом слое. На расстоянии нескольких миль от устья вода в море становится мутной, грязно-бурого цвета. Такой же цвет имеет и вода самой реки. Вплотную к ее берегам подходит непроходимо густой влажный, вечнозеленый, экваториальный лес.В южном полушарии выделяются два района высокой продуктивности: у берегов Анголы и Намибии, в пределах южных субтропиков; очень обширный Аргентинско-Патагонский шельф в умеренной зоне.
Особый интерес представляет район моря Скотин в южном субполярном (субантарктическом) поясе. Оно окаймлено несколькими архипелагами, отдельными островами и подводными возвышенностями. Некоторые океанографы считают более правильным относить его к Тихому океану, так как с Тихим оно соединено широким проливом Дрейка, а от Атлантического отделено архипелагами островов и подводным хребтом. Из-за групп островов и подводных возвышенностей широтный перенос вод несколько нарушается, циркумполярное течение отклоняется на северо-восток, потоки вод образуют сложную систему поверхностных течений с завихрениями и противотечениями в районе островов. Море Скотия лежит между 53 и 61° с. ш., что соответствует умеренному поясу северного полушария. На таких широтах расположено Северное море. Но из-за более холодного климата в южном полушарии здесь господствуют субполярные условия.
От других районов субантарктического пояса море Скотия отличается большей динамичностью вод, значительным развитием вертикальной циркуляции, чередованием на сравнительно близком расстоянии областей погружения и подъема вод. В результате условия для образования промысловых скоплений организмов резко меняются от места к месту.
Особенно сильно отличается по термике от северных широт эта акватория летом. Прогрев крайне слабый, приблизительно до 3–4 °C на поверхности. В зимнюю половину года развивается вертикальная конвективная циркуляция. Вода перемешивается до значительной глубины. От поверхности до дна она холодная (0–3 °C), обильно обеспечена кислородом и биогенными веществами. В подповерхностный слой приходят несколько более теплые воды с севера. Кроме солей азота и фосфора, здесь большое значение имеют силикаты. Диатомовые водоросли, составляющие основу фитопланктона, строят из него свой кремневый скелет.
Освещенность поверхности моря невелика, так как густая слоистая облачность поглощает значительную часть лучей. Очевидно, из-за этого много питательных солеи недоиспользуется фитопланктоном. Фитопланктон, в свою очередь, не полностью поедается зоопланктоном. Таким образом, пищевая цепь оказывается несбалансированной. Огромная масса биологической энергии пропадает.
Большой интерес представляют узкие островные шельфы, с их сложным рельефом, чередованием подводных возвышенностей и затопленных древних ледниковых долин.
В этих подводных троговых долинах гидрологические условия относительно спокойные, стабильные.
В северных водах Атлантики киты были выбиты в XVII–XVIII вв., в южном полушарии это произошло лишь после изобретения гарпунной пушки и почти завершилось в Атлантическом секторе лишь в наши дни. Так, на острове Южная Георгия несколько лет назад законсервирована норвежская береговая база по добыче и переработке китов. До сих пор на берегах лежат огромные кости животных, выброшенные штормовым прибоем. В настоящее время в связи с истощением рыбных ресурсов в некоторых традиционных районах лова северного полушария начинается рыбохозяйственное освоение вод.
Прежде считалось, что в Субантарктике вообще едва ли возможно образование больших промысловых скоплений рыб. Работы советских научных экспедиций и промысловых судов показали, что в высоких широтах южного полушария в различных географических районах и при разной океанологической обстановке формируются очень значительные скопления промысловых рыб: путассу, нототений, белокровных рыб, клыкача и др.