Отряд капитана Ушакова (600 штыков, две пушки, 4 пулемета) еще 28 августа взял Лепсинск. Красный гарнизон города ушел в село Покатиловское. Отряд Ушакова, усиленный казаками Лепсинской и Сарканской станиц, 31 августа осадил Покатиловку, но 4 сентября, после подхода к красным сводного отряда Петренко, снял осаду и отошел к Саркану.
Но 10 сентября белые вновь освободили Лепсинск, а красные из города ушли к большому украинскому селу Черкасскому И хотя на следующий же день сводный отряд Петренко ушел из Черкасского на Гавриловку (Талды-Курган), здесь возник повстанческий район украинцев в тылу белых. В Черкасском и соседних с ним селах Лепсинского уезда — Петропавловском, Осиновском, Колпаковском, Андреевском, Успенском и Глинковском — проживали около 30 000 украинцев, настроенных пробольшевистски и резко антиказачьи. Уходя, Петренко оставил им 2 пулемета, десятки винтовок и тысячи патронов. Несмотря на изоляцию от основных сил красных, украинцы более года действовали в тылу казаков, оттягивая на себя их силы и не позволяя ударить на Верный.
Осенью 1918 г. фронт стабилизировался по линии песков Сымбыл — Кум — Аксу — Абакумовка — Тобольск — Копал. Воинские части стояли в населенных пунктах, высылая в наиболее важные места заставы и конные разъезды. В 100 км севернее лежал осажденный белыми район Черкасской обороны.
В передышках между боями семиреки вооружились и переформировались в воинские части. Вместо стихийно возникших станичных сотен появились отряды милиции и самоохранные сотни, а в сентябре воссоздан 1-й Семиреченский полк (29 офицеров, 910 казаков, 4 пулемета), приданный 5-й Сибирской стрелковой дивизии. Впоследствии полк переименован в 1-й конный Алатавский полк Семиреченского войска. Создали еще 2 полка, которые позже вошли в состав Отдельной Семиреченской бригады, начальником которой с 14 мая 1919 г. стал войсковой атаман генерал-майор Ионов.
В октябре 1-й Семиреченский полк вместе с 2-й сотней 3-го Сибирского полка и стрелковой ротой отразил атаки красных, стремившихся прорвать фронт и соединиться с украинцами.
В декабре пришла из Семипалатинска партизанская дивизия атамана Б. В. Анненкова (1800 штыков, 1770 шашек, 6 пушек) для уничтожения повстанцев вокруг Черкасского. Казаки уже в январе 1919 г. попытались с ходу взять одно из сел — Андреевку, но увязли в боях и воевали с украинцами до октября, когда удалось сломить сопротивление противника.
Дивизию Анненкова пополнил лейб-атаманский полк семиреков. Позже, при формировании Киргизской конной бригады полковника Н. Д. Кольца, офицеры-казаки служили в её рядах.
У Анненкова не сложились отношения с офицером генерального штаба атаманом Ионовым. Имея блестящее образование, высоко ценя боевую мощь казачьих частей, свои представления об этой древней цивилизации он, видимо, черпал из замечательных картин И. Репина и В. Сурикова. В 1918 г. генерал Ионов решил «оказачить» Семиреченскую область, считая, что это сгладит конфликт между украинцами и казаками, а затем искоренит большевизм в Семиречье. Сибиряки-старожилы записались в казаки, вызвав ненависть украинцев. Анненков, выступая резко против оказачивания, называл Ионова сумасшедшим.
Инспектировавший Семиречье в 1919 г. генерал Н. П. Щербаков, сам семирек, в докладе совету министров в Омске положительно оценил работу Анненкова. Плохо отзывался об атамане Ионове гражданский управляющий Семиреченской областью Балабанов. Колчак в октябре отозвал Ионова в Омск и назначил начальником штаба при инспекторе стратегического резерва генерале Хрещатицком. Вместо него заместителем войскового атамана Колчак назначил Щербакова, который нашел общий язык с Анненковым
[37].Бои летом шли в районе Черкасской обороны. В июле казаки взяли села Константиновское, Надеждинское, Глинковское, Колпаковское, Осиновское и Андреевское. Анненковцы несколько раз ходили в «психические» атаки.
В то же время казаки пытались нанести удар во фланг красным, в районы Джаркента, Кольджата и Пржевальска из китайского Синьцзяна. Полковник П. И. Сидоров из семиреков, алашей, таранчей (уйгуов) сформировал 2 отряда есаула Сапожникова и капитана Бредихина, по 400–500 человек. Полковник Брянцев — отдельную стрелковую бригаду (Текесский конный, Семиреченский или Кольджатский пластунский полк).
В июле-сентябре эти отряды прорывались из Китая, уничтожали мелкие части РККА, осаждали Пржевальск и Джаркент, прикрывали отход в Китай восставших казаков и крестьян Пржевальского уезда и оттягивали на себя силы красных. После падения Черкасской обороны казаки Сидорова взяли Хортое, Басканчак и Тышкан. Брянцев занял Дубун, Подгорное, Чунджу, удерживая их до февраля 1920 г. Взять Джаркент и Пржевальск так и не удалось.