6 апреля 1945 года Ставропольский крайком ВКП(б) и исполком краевого Совета депутатов трудящихся направили письмо заместителю председателя Совета народных комиссаров СССР (СНК СССР) В. М. Молотову и секретарю ЦК ВКП(б) Г. М. Маленкову с просьбой оказать помощь в восстановлении курортов Кавказских Минеральных Вод. СНК СССР 29 июня 1945 года вынес специальное постановление «О восстановлении санаторно-курортных учреждений на Кавказских Минеральных Водах», которое явилось генеральным планом работы краевых властей на второе полугодие 1945 года. В принятом постановлении говорилось, что первоочередными объектами, подлежащими восстановлению, должны быть здания санаториев и лечебных учреждений, городские общественные и административные здания, коммунальные предприятия, водопроводная и канализационная сеть, жилые дома, надземные и подземные сооружения гидроминеральной базы курортов, парки, оранжереи, парниковое хозяйство, дороги и мосты. С марта 1943 до 29 июля 1945 года в здании санатория имени Калинина был размещен эвакогоспиталь № 5420 второго формирования по реабилитации тяжелораненых солдат и офицеров (после оккупации всем госпиталям второго формирования ГВС НКО СССР присваивался новый номер, поэтому № 1779 сменили на № 5420), а в начале августа в здании уже началась подготовка к капитальному ремонту для приема ответсотрудников центрального аппарата СНК и Президиума Верховного Совета СССР.
В сентябре 1945 года управделами СНК СССР Я. Е. Чадаев на основании распоряжения председателя СНК СССР И. В. Сталина составил аналитическую справку о возможном предстоящем ремонте и реконструкции лечебно-санаторной базы ХОЗУ УД СНК СССР, располагающейся на территории Кавказских Минеральных Вод. По итогам совещания в Кремле, состоявшегося 12 сентября 1945 года, было принято Постановление СНК СССР № 2403«с», регламентирующее этапы восстановления, реконструкции и строительства новых корпусов лечебно-санаторных учреждений, находящихся в ведении ХОЗУ Управления делами СНК СССР. На основании данного постановления здание санатория имени М. И. Калинина с 12 сентября 1945 года перешло из ведения Главного управления эвакогоспиталей Наркомздрава СССР в подчинение Управления делами СНК СССР и лечебно-санитарного управления Кремля.
С конца сентября 1945 по февраль 1946 года в здании санатория имени Калинина ХОЗУ СНК СССР проводило капитальный ремонт вместе со Ставропольским краевым трестом гражданского строительства Ставропольгражданстрой. В здании санатория после ремонта было размещено трофейное медицинское оборудование из Германии (рентгенаппарат, аппараты для физиотерапии – электрофореза), кухонное для столовой, оборудована лаборатория для проведения анализов.
С 15 марта 1946 года санаторий СНК СССР имени М. И. Калинина получил новое название – санаторий Хозяйственного управления Совмина СССР имени М. И. Калинина, не изменив своей подчиненности, организационно находясь в ведении Управления делами СМ СССР, но в оперативном управлении лечебно-санитарного Управления Кремля при СМ СССР. 14 мая 1947 года Совет министров СССР утвердил Положение о Минераловодской группе санаториев и домов отдыха Хозяйственного управления Совета министров СССР, на основании которого произошла очередная реорганизация правительственных лечебно-оздоровительных учреждений на Кавказских Минеральных Водах. Санаторий имени Калинина, с 14 мая 1947 года находящийся в ведении ХОЗУ Управления делами Совмина СССР, был передан в оперативное подчинение ЛСУК при СМ СССР по настоянию его руководителя профессора Петра Ивановича Егорова, что повысило его статус.
Имеющаяся в Сети информация о том, что санаторий имени Калинина с 1948 года «восстанавливался Управлением делами ЦК КПСС», является настоящим дилетантским бредом, если не сказать хуже (например, данные сведения изложены на официальном сайте санатория имени Калинина http://sankalinin.org/o-sanatorii/istoriya.html). Для тех, кто не знает, объясняю, что только на XIX съезде ВКП(б), который проходил с 5 по 14 октября 1952 года (!), было решено переименовать ВКП(б) в КПСС, и по этой причине Управление делами ЦК КПСС было образовано только 14 октября 1952 года, а возглавил это структурное подразделение Д. В. Крупин. Историю надо знать, товарищи! Постановлением Совета министров СССР от 24 апреля 1953 года Лечебно-санитарное управление Кремля было реорганизовано в 4-е управление Министерства здравоохранения СССР, и санаторий имени М. И. Калинина в Ессентуках с этой даты действительно перешел из ведения ХОЗУ Совмина СССР на баланс Управления делами ЦК КПСС, и под его юрисдикцией он оставался до 6 ноября 1991 года.
В 2002 году на базе санатория имени Калинина открылся Федеральный центр по реабилитации больных сахарным диабетом. В настоящее время санаторий рассчитан для проживания и лечения 360 человек одновременно. Санаторий располагает хорошей лечебной базой с широким набором бальнеофизиотерапевтических процедур, современными методами диагностики и лечения.