Как только дела в Сиракузах были до некоторой степени приведены в порядок, Дионисий обратил свое оружие против сикелов, которые во время последней войны свергли с себя сиракузское владычество. Прежде всего он осадил город Гербесс, расположенный в горах к северу от Сиракуз. Но здесь вспыхнул бунт среди сиракузских ополченцев; они убили своего начальника, назначенного Дионисием, избрали себе сами новых стратегов и призвали на помощь бежавших в Этну всадников. Тирану ничего другого не оставалось, как поспешно возвратиться со своими наемниками в Сиракузы. Мятежники погнались за ними; они заняли возвышенность Эпипол и приступили к осаде города. Регий и Мессена прислали им на помощь весь свой флот; метрополия, Коринф, также поддерживала восставших, а коринфянин Никотел принял главное начальство над ними. Положение Дионисия сделалось настолько критическим, что он серьезно стал подумывать о капитуляции и завязал переговоры с мятежниками. Но в эту минуту, когда победа была, казалось, обеспечена, пыл осаждающих начал ослабевать и многие из них разъехались по своим поместьям. Между тем Дионисию удалось привлечь к себе подкрепления, в том числе отряд из тысячи двухсот кампанских всадников, состоявший до тех пор на службе у Карфагена. С этим войском Дионисий предпринял атаку на позицию осаждающих в предместье Темените; мятежники потерпели полное поражение, но число убитых было невелико, потому что, как только победа была решена, тиран прекратил дальнейшее кровопролитие. Он позаботился также о почетном погребении павших и этим подготовил себе путь к соглашению с противниками. Республиканская армия после этого поражения распалась; однако значительная часть ее, по преданию, 7000 человек, снова собралась в Этне. Наконец, при посредничестве спартанцев заключен был договор, по которому Дионисий даровал всем участникам восстания полную амнистию. Большинство мятежников вернулось на родину; те немногие, которые не желали принести повинную и оставались еще в Этне, были в следующем году без труда изгнаны оттуда тираном.
Государственное устройство Сиракуз было упорядочено теперь таким образом, что Дионисий сохранил военную власть, которую вверило ему Народное собрание летом 405 г. В силу этого полномочия ему предоставлялось верховное начальство над армией и флотом государства; он назначал офицеров, адмирала, комендантов крепостей и начальников отдельных частей войска. Кроме того, ему были предоставлены и гражданские полномочия, какими в республиканское время пользовались стратеги: представительство в сношениях государства с иностранными правительствами, председательство в Народном собрании, взимание экстраординарных прямых налогов, предназначенных на военные нужды. Без сомнения, в его кассу притекала также часть постоянных государственных доходов. Но Совет и Народное собрание были сохранены; без их согласия тиран не мог ни объявлять войны, ни взимать прямых налогов с имущества граждан. Вероятно, и большинство гражданских чиновников избирались Народным собранием. Вообще Дионисий смотрел на себя как на представителя сиракузского народа; подобно древним тиранам, он не принял царского титула, и на его монетах написано имя Сиракуз.
Теперь Дионисий мог снова приняться за осуществление своих завоевательных планов, и в этот раз с большим успехом. Он покорил один за другим халкидские города Наксос, Катану и Леонтины; большая часть их жителей должна была переселиться в Сиракузы. Наксос был разрушен и область его отдана соседним сикелам; в Катане поселены были кампанские наемники (403 г.). Сикелы также должны были признать над собою верховную власть Дионисия; чтобы держать их в подчинении, на западном склоне Этны основана была военная колония Гадранон, названная так по имени сикельского божества, знаменитый храм которого находился в этом месте (400 г.). С Мессеной Дионисий заключил союз, тогда как Регий отверг все дружественные предложения тирана; тем охотнее вошли с ним в соглашение италийские Локры, издавна враждовавшие с регийцами. Со времен Гиерона Сиракузы еще на разу не достигали такого могущества, как теперь.