Создание такого масштабного водохранилища, как Рыбинское (которое на момент создания было крупнейшим в мире) привело к значительным изменениям окружающей природной среды. Для изучения этих изменений 18 июля 1945 г. был создан Дарвинский заповедник, в настоящее время имеющий статус биосферного.
Уникальной особенностью Рыбинского водохранилища стало образование плавучих «островов» из всплывших торфяников. Это явление активно шло первые 5—15 лет после заполнения водохранилища, далее этот процесс приостановился, а плавающие «острова» прибились к отмелям и заросли древесно-кустарниковой растительностью. Другим характерным явлением были находящиеся в прибрежной зоне полузатопленные леса — при подготовке ложа водохранилища к затоплению было сведено 11 млн м³ товарного леса, но в то же время большие участки леса остались невырубленными. Интересно, что затопленные леса стали своего рода биологическими оазисами — там гнездилось и кормилось большое количество птиц, скапливалась рыба. Однако в течение 20 лет затопленные леса были разрушены подвижками льда.
Вследствие снижения водообмена и особенно усиления загрязнения водоема сточными водами, содержащими фосфор, регулярно наблюдается цветение воды. В то же время за счет эффекта разбавления и отстаивания загрязнителей в Рыбинском водохранилище происходит самоочищение сточных вод. В прибрежной зоне изменился микроклимат — увеличилась сила и повторяемость ветров, весной водохранилище оказывает охлаждающее воздействие, осенью — отепляющее; вегетационный период сократился на 4–5 дней.
С начала 1950-х гг. идут дебаты о целесообразности спуска воды из Рыбинского водохранилища. Эта мера позволила бы вернуть в сельскохозяйственный оборот большие площади плодородных земель. Однако проведенные исследования показали, что экономическая выгода от такого решения не компенсирует финансовые потери на переустройство инфраструктуры региона: реорганизацию системы водоснабжения, прекращения грузовых перевозок водным транспортом из-за обмеления фарватера, проведение противопаводковых мероприятий.
С другой стороны, водохранилище является естественным накопителем и «разбавителем» вредных веществ, попадающих в Волгу вместе со стоками промышленных предприятий.
Обнажившееся дно водохранилищ будет представлять собой смесь болот и пустынь, для освоения которых потребуются годы и огромные материальные затраты. С возвращением волжских наводнений придется переселять большое количество людей, поселившихся в пойме Волги, поскольку их дома окажутся в зоне затопления. Потребуется поиск источников воды для больших городов и предприятий.
Экологический баланс, сложившийся за десятилетия, будет нарушен. Пострадают рыболовство, курортно-туристическое хозяйство и природоохранные территории, включая Дарвинский биосферный заповедник.
Специально для изучения континентальных вод и особенно создаваемых водохранилищ в 1956 г. в поселке Борок на берегу Рыбинского водохранилища был создан Институт биологии внутренних вод.
Основой института стала биологическая станция, созданная еще в 1923 г. в усадьбе Николая Александровича Морозова (1854–1946). Член организации «Народная воля» с 1882 по 1905 г. находился в заключении в Петропавловской, а затем в Шлиссельбургской крепостях.
В 1939 г. в своей усадьбе Морозов предложил создать биологическую станцию.
В состав института входят:
— Лаборатория экологической биохимии;
— Лаборатория популяционной биологии и генетики;
— Лаборатория иммунологии;
— Лаборатория экспериментальной экологии;
— Лаборатория альгологии;
— Лаборатория экологии рыб;
— Лаборатория высшей водной растительности;
— Лаборатория систематики и географии водных растений;
— Лаборатория экологии водных беспозвоночных;
— Лаборатория микробиологии;
— Лаборатория экологической паразитологии;
— Лаборатория гидрологии и гидрохимии;
— Лаборатория физиологии и токсикологии.
С 1956 по 1986 г. директором института в Бороке был знаменитый полярный исследователь Иван Дмитриевич Папанин.
В соответствии с распоряжением Президиума Академии наук СССР от 16 июля 1987 г. № 10123—1158 институту присвоено имя знаменитого полярника, его первого директора, доктора географических наук И.Д. Папанина, сыгравшего большую роль в создании института.
Постановлением Президиума Российской академии наук от 18 декабря 2007 г. № 274 Институт биологии внутренних вод им. И.Д. Папанина Российской академии наук переименован в Учреждение Российской академии наук Институт биологии внутренних вод им. И.Д. Папанина РАН.
Автор дважды бывал в институте и в музее И.Д. Папанина. Труды института — отдельная тема. Меня поразили огромные бассейны, аквариумы, опытные поля, которые помогали в режиме реального времени моделировать практически все процессы, проходящие в водохранилищах. Обратим внимание на время создания института — середина 1950-х гг., когда создавался ракетно-ядерный щит, осваивалась целина, разворачивалось массовое жилищное строительство и т. д. И тогда деньги нашлись на создание Института биологии внутренних вод.