К 1718 г. составили план коллежского устройства, установили должностной состав каждой коллегии, назначили президентов и вице-президентов, и всем коллегиям было предписано сочинить себе на основании шведского устава регламенты. Первоначально установлено было 9 коллегий: 1)
Преобразование Сената
Двойственное значение Сената, как участника в законодательстве и вместе как высшего органа подзаконной исполнительной власти, отражалось и на ходе его устроения. При учреждении коллегий Петр указал их президентам сидеть в Сенате; Сенат получал вид комитета министров. Создавалось перекрестное отношение: президенты коллегий, как сенаторы, становились начальниками своих коллежских товарищей, а как главы учреждений, ответственных перед Сенатом, были подчинены самим себе, как сенаторам.
В 1722 г. президентов указано оставить в Сенате, а на их места выбрать других. Только президенты трех важнейших коллегий, Иностранной и обеих воинских, призывались в Сенат в особых случаях. Но и в этой перемене сенатского состава опять колебание: Петру приходилось бороться с недостатком «заобычных» людей, годных быть сенаторами, и четыре месяца спустя коллежским президентам велено было сидеть в Сенате равно с другими, только двумя днями в неделю реже.
Сенат облечен был весьма обширными полномочиями. В общей перестройке управления сверху донизу, предпринятой Петром в последние годы, он являлся руководителем, распределял права, создавал юридические нормы, вводил новые налоги, разрабатывал мимолетные указы царя. Без согласия Сената нельзя было ничего начинать, тем менее вершить; он — заместитель собственной его величества персоны в ее отсутствие. Но сенат был проводником самодержавной воли, не имея своей собственной; его полномочия были приказчичьего, а не хозяйского характера, не права, а ответственные поручения; он — механический прибор управления, а не политическая сила.
В 1715 г. при Сенате была учреждена должность генерального ревизора, или надзирателя указов, на которую назначен был сын генерал-президента Ближней канцелярии и штатного обер-шута Никиты Зотова, человек образованный, учившийся за границей. Генеральный ревизор записывал сенатские указы, следил за своевременным исполнением их и объявлял о неисправных чиновниках Сенату, обязанному немедленно штрафовать виновных, а неисполненное дело «довершивать», в противном случае доносил на сенаторов государю.
В 1720 г. сделан был более сильный нажим на Сенат; предписано было наблюдать, чтобы здесь «все было делано порядочно и суетных разговоров, крика и прочего не было», Следить за этим, поддерживать порядок в Сенате обязан был обер-секретарь Сената Щукин, правитель сенатской канцелярии и докладчик. Через год обязанности и генерального ревизора и обер-секретаря возложили на военных.
Наконец, еще через год приискали настоящего дядьку для правительствующего ребенка: это был генерал-прокурор при Сенате, должность которого наметил указ 12 января 1722 г. Это представитель верховной власти и государства перед Сенатом. Он становился прямым начальником сенатской канцелярии, ему же были подчинены фискалы. Генерал-прокурор не только наблюдал за порядком и приличием в Сенате, но и входил в суждение о его действиях и делал ему указания на неправоту или пристрастие, а в случае несогласия с этими указаниями останавливал дело и доносил государю. Генерал-прокурору предоставлена была и законодательная инициатива. Усмотрев дела, не разъясненные законом, он предлагал Сенату учинить на них ясные указы. Таким образом, генерал-прокурор, а не Сенат, становился маховым колесом всего управления.