В середине 1860-х годов, после завершения Крымской и Кавказской войн, Россия смогла перейти к более активным действиям в Туркестане. Опираясь на Сырдарьинскую, Кокандскую и Новосибирскую (Семиреченскую) укрепленные линии, русские войска в 1864 году устремились в Среднюю Азию. 24 октября 1862 года был взят Пишпек (ныне Бишкек), а 16 июня 1865 года генерал М. Г. Черняев с небольшими силами легко захватил столицу Кокандского ханства Ташкент.
Эмир Бухары попытался помочь соседям, но против него были направлены силы под командованием генерала К. П. Кауфмана, который в 1867 году был назначен генерал-губернатором Туркестана. В 1868 году он захватил Самарканд, и Бухара признала протекторат русского царя.
В 1873 году Кауфман, полагавший, что «окончательно решить туркменский вопрос» можно «или смирением туркмен, или совершенным их уничтожением» чрезвычайно жесткими мерами, принудил к повиновению Хивинское ханство. В 1876 году, воспользовавшись вспыхнувшей в Кокандском ханстве междоусобицей, русские войска под командованием К. П. Кауфмана и М. Д. Скобелева окончательно ликвидировали его самостоятельность. Оно вошло в состав Российской империи под именем Ферганской области.
М. Д. Скобелев
В 1880 году Россия предприняла экспедицию против текинцев, населявших Ахал-Текинский оазис (в современном Туркменистане). Войска генерала Скобелева, двигавшиеся от Красноводска, захватили несколько крепостей. Одновременно с продвижением войск строилась железная дорога, облегчавшая снабжение и переброску подкреплений. В декабре 1880 года превосходящие силы русских войск начали осаду крепости Геок-Тепе, которую защищали более 30 тысяч человек. 12 января 1881 года крепость пала. Защитники ее подверглись практически полному истреблению: у солдат был приказ пленных не брать.
В марте 1884 года к России был присоединен Мерв, а на следующий год русские войска вышли к границам Афганистана и разбили афганские войска на реке Кушке. (Это едва не привело к войне с Великобританией, считавшей Афганистан своей сферой влияния.) К 1888 году Закаспийская железная дорога была продлена до Самарканда, и после этого господство России в Туркестане больше не вызывало сомнений. Бухарский эмират и Хивинское ханство под протекторатом России сохранили внутреннюю автономию.
Последним приобретением России в Средней Азии стал Восточный Памир, присоединенный в 1895 году.
Сумерки империи
2 марта 1881 года Россия увидела нового императора Александра III. Гибель отца наложила тяжелый отпечаток на характер государя и на все его царствование. Вначале Александр III распорядился из уважения к памяти своего отца оставить его повеления неизменными. Лорис-Меликов и большинство министров высказались за публикацию конституционного проекта. Против был лишь обер-прокурор Святейшего синода К. П. Победоносцев. Но 29 апреля особым манифестом Александр III объявил, что, приняв престол «с верою в силу и истину самодержавной власти», будет утверждать и охранять ее для блага народного «от всяких на нее поползновений». Реформаторы Лорис-Меликов, военный министр Милютин и министр финансов Абаза подали в отставку. В течение нескольких месяцев после этого были сменены все высшие правительственные чиновники. Их место заняли люди с репутацией реакционеров. Главную роль в правительстве стал играть Победоносцев, утверждавший идею гармонии между православной церковью, самодержавной властью и народом, под которым прежде всего понималось крестьянство. Манифест превратился в политическую программу, которой император следовал до конца своего правления.
За два месяца между коронацией и появлением манифеста произошли важные события: террористы, организовавшие убийство Александра II, были арестованы и осуждены. Пятеро руководителей «Народной воли», в том числе А. И. Желябов и С. Л. Перовская, повешены. Это, однако, не решило проблему терроризма – разветвленная организация еще несколько лет сопротивлялась властям, устраивая покушения на чиновников. Ради безопасности Александр III поселился в Гатчине, а 14 августа 1881 года в целях «водворения спокойствия и искоренения крамолы» было принято Положение об усиленной и чрезвычайной охране, действовавшее вплоть до 1917 года и позволявшее правительству при необходимости вводить в той или иной местности осадное положение. Одной из последних акций террористов стала попытка убийства Александра III. В 1887 году казнили пятерых студентов, готовивших покушение. Одним из них был Александр Ульянов, старший брат Владимира Ульянова, которому суждено будет возглавить Октябрьскую революцию 1917 года.
Александр III в мундире лейб-гвардии Преображенского полка. Нач. 1880-х гг.
Императрица Мария Федоровна, супруга императора Александра III. 1881 г
Террористическое движение пошло на спад, но вряд ли благодаря полицейским мерам. Террористов было не так уж много, а деятельность их, завершившаяся убийством императора, явно показала свою бесплодность. Общество уже не сочувствовало террористам, но еще менее оно поддерживало правительство, жестоко обманувшее его надежды.