Острую дискуссию среди еврейских военнопленных вызвало сообщение, что царь якобы планирует даровать еврейским солдатам, геройски сражавшимся при обороне Порт-Артура, право жительства на всей территории империи. Тем самым вместо равноправия всего еврейского населения России, царские власти обещали даровать гражданские права только относительно небольшой группе избранных евреев. Трумпельдор резко выступил против этого плана. Он ясно заявил, что равноправие должно быть для всех евреев и никто не должен пользоваться какими-либо привилегиями в этом вопросе.
Существует красивая легенда о том, что до японского императора дошли сведения о русском военнопленном, герое обороны Порт-Артура, столь много делающем для своих товарищей по плену. Он пожелал встретиться с ним. Прямо из лагеря для военнопленных Трумпельдор был доставлен в императорский дворец в Токио.
В русском мундире с Георгиевскими крестами на груди унтер-офицер Иосиф Трумпельдор был представлен японским генералом императору. В ходе беседы Микадо спросил, за какие подвиги Трумпельдор был удостоен столь высоких наград. Услышав краткий рассказ Иосифа, Микадо спросил, почему столь доблестный воин не был произведен в офицеры. Ответ Трумпельдора, что в России евреям запрещено присваивать офицерские звания, поверг японского императора в изумление. Он сказал, что по-своему отметит его воинский подвиг и образцовое поведение в плену: император дарует ему специально изготовленную руку-протез, на которой золотыми буквами была сделана надпись: "Эту руку жалует японский император герою Трумпельдору за его полезную деятельность во время плена".
Девятого августа 1905 года в Портсмуте (США) при посредничестве президента Теодора Рузвельта начались мирные переговоры между Россией и Японией. Мирный договор был подписан 23 августа (5 сентября) 1905 года. Одним из его условий стало возвращение русских военнопленных на родину.
Трумпельдор оказался в одной из первых групп русских военнопленных, возвращавшихся в Россию. Провожать его пришли тысячи товарищей по плену, самых разных национальностей. Перед отъездом японский генерал вручил ему запечатанный пакет, адресованный командующему русскими войсками на Дальнем Востоке генералу Линевичу. Прибыв в Харбин, Иосиф передал пакет в штаб. Как выяснилось, в письме японское командование выражало восхищение воинским подвигом Трумпельдора, его образцовым поведением в плену и просило русское командование достойно наградить храброго и преданного своей стране русского воина.
Вскоре генерал Линевич пригласил Иосифа в свою ставку. На плацу были выстроены в парадном строю полки. Генерал Линевич вместе с Трумпельдором обошел войска и произнес краткую речь, в которой рассказал о подвиге воина, его деятельности в плену и сообщил, что вскоре Трумпельдор будет лично представлен государю императору. В ответ над плацем прогремело троекратное "Ура!".
Издававшаяся в Ростове газета "Приазовский край" 5 апреля 1906 года сообщала читателям:
Встреча с Родиной произвела самое удручающее впечатление на еврейского солдата, сражавшегося за Россию: недавно прокатившаяся по всей России волна еврейских погромов тяжело ударила по ростовским евреям, еще не оправившимся от кровавого погрома, организованного местными черносотенцами в октябрьские дни 1905 года.
Ростовские евреи, как и евреи всего юга России, испытали три волны еврейских погромов (1881-1884, 1905-1906 и 1918-1920). Из них погромы в октябре 1905 года вызвали больше всего жертв. По числу убитых (176 человек) и раненых (около 500 избитых и изувеченных) он оказался одним из самых крупных еврейских погромов в России начала XX века. Городские власти не предпринимали никаких мер для прекращения продолжавшегося три дня погрома.