Французская и австрийская армии стояли друг напротив друга на протяжении шести недель, разделенные только рукавом Дуная шириной шестьдесят ярдов (55 м), который протекает севернее острова Лобау. Австрийцы укрепили свои позиции и приготовились дать отпор французам, предполагая, что они будут переходить реку по мосту напротив Эслинга, который Наполеон приказал восстановить. Но Наполеон приказал починить мост, чтобы обмануть австрийцев, потому что он намеревался перейти через реку ниже по течению по построенным по его приказу временным мостам. Он переправился через реку в ночь с 4 на 5 июля, застал австрийцев в неблагоприятный момент и вынудил их поменять свои планы и диспозиции. (Австрийская армия эрцгерцога Карла насчитывала 110 000 и 452 орудия, у Наполеона было 170 000 и 584 орудия. Ожидался подход еще одной австрийской армии эрцгерцога Иоанна. –
И хотя это сражение, как и предыдущее, не было по-настоящему решающим, Наполеон и Австрия решили закончить войну. 14 октября 1809 г. был подписан договор, по которому австрийцы согласились разорвать все торговые отношения с Англией и признать все изменения, которые произошли или могли произойти в Испании и Португалии. 10 марта 1810 г. дочь императора Австрии стала супругой императора Франции.
Тем временем континентальная блокада Англии создала серьезные затруднения не только для Англии, но и для определенных государств на материке, особенно России. Это и некоторые другие обстоятельства, вытекающие из Тильзитского договора, привели к постепенным, но явным изменениям к худшему в отношениях между царем Александром I и Наполеоном. После двух лет подготовки к войне произошел разрыв, которому 24 марта 1812 г. предшествовало заключение союзнического договора между Россией и Швецией. 9 мая Наполеон выехал из Парижа в Дрезден – место встречи союзников (Франция, Австрия и Пруссия) и начал переговоры с царем. Ввиду того что они не принесли плодов, он 22 июня объявил войну и уехал в армию.