В очень разъясняющей статье "Мысли человека" Сайид Ахмад Хан обсуждает проблему разума в деталях. После того, как было дано определение разума, как было приведено выше, он говорит, что человек отличается от животных вследствие разумности, что налагает на него обязанности и ответственность намного большие, чем на животных. Главная функция разума, согласно ему - приобретать знания о природе и реальности вещей. Но это знание тесно связано с убеждённостью (якин). "Я полностью осознаю", говорит он, "что без убеждённости знание невозможно ни в мирских делах, ни в религии. Но какого рода убеждённость нам нужна? Я знаю, например, что десять больше трёх. Если кто-то утверждает обратное, и в подтверждение своего утверждения превращает палку в змею, я буду, без сомнения, крайне удивлён его необыкновенным трюком, но это никогда не ослабит мою веру, что десять больше трёх. Без убеждённости такого рода невозможно продвигаться дальше". Но важный вопрос - как и где приобрести такого рода убеждённость? Он исследовал веру различных людей. Христианин, например, верит в доктрину троицы, потому что утверждается, что этой доктрине учил Иисус, а Иисус, как принято считать, творил много поразительных чудес. Но такие верования, основанные, как упомянутое выше, на авторитете особенной личности, и подкреплённые сверхъестественными поступками, не могут иметь под собой какую-либо твёрдую почву. Для того, чтобы быть приемлемыми, они должны быть одобрены разумом и здравым смыслом. Он делает вывод: "Я пришёл к выводу, что один только разум - это инструмент, который может решить вопрос, и привести к неизбежному убеждению. Но не подвержен ли разум ошибкам? Да, подвержен, и мы не можем этому помочь. Поскольку разум используется почти повсюду, разум одного человека может быть поправлен разумом другого, а разум одной эпохи - разумом другой. Без этого ничего нельзя достичь".
Однако, в истории мусульманской мысли и особенно среди мистиков разум часто ставили в подчинённое положение по отношению к интуиции или мистическому открытию истины (кашф). Газали, например, чья аргументация (изложенная им в "Мункид") была перенята Сайидом Ахмад Ханом, считал, что есть более высокая ступень по сравнению с разумом, где разум обнаруживает себя таким же подверженным ошибкам и имеющим недостатки, как чувства и ощущения за решёткой [bar] разума. Но Сайид Ахмад не желал принимать этот аргумент. Он говорил, что, предполагая, что такое состояние существует, как мы можем судить, является ли знание, добытое таким путём, действительным, или же нет? Противоречия в сообщениях о мистическом опыте вошли в поговорку. Каков же критерий, которым мы можем определить, какие из них истинные, а какие ложные? Естественно, у нас нет ничего другого кроме разума, чтобы решить этот вопрос.
Однако, согласно Сайиду Ахмад Хану, нет качественного различия между разумом и [пророческим] откровением. Сайид Ахмад Хан не признавал общепринятого различения между естественными и ниспосланными религиями, ибо это означало бы, что ниспосланная религия - это нечто отличающееся или, в определённых отношениях, даже антагонистичное естественным и разумным требованиям человека. Он смотрел на проблему их взаимосвязи биологически, и считал вдохновение естественным раскрытием инстинктивных и мыслительных способностей человека. Все насекомые и животные обладают инстинктивными способностями, которые Коран называет уахи, откровение (xvi, 68), и, т. о., считает инстинкт, разум и вдохновение принадлежащими к одной и той же категории, пусть и с различием в уровне на каждой стадии существования. Результатом природных дарований человека, которые он называл уахи, является то, что в различные эпохи и в различных регионах люди были в состоянии развить почти универсальные стандарты моральных ценностей. Те, кто наделён разумом в высшей степени, являются руководителями и вождями людей, Шах Вали Аллах называл их муфхимун. Согласно Сайиду Ахмаду, эти руководители и вожди возникают во всех областях человеческой жизни, как светской, так и религиозной, и все они без исключения получают божественное озарение или уахи. Изобретатель нового механизма, первооткрыватель доселе неизвестных областей мира, композитор, сочинивший красивую симфонию - все они являются получателями духовного откровения в своих особых сферах. Различие между пророками и другими гениями, согласно ему, обусловлено различием сфер, в которых они работают. Пророки являются духовными целителями, и их основная и единственная [sole - также переводится как "исключительная"] функция - дать новые ориентиры духовной и моральной жизни людей.