Мысль о церковной унии православных западно-русов с латинской Церковью, давно занимавшая Пап Римских и латинское духовенство, стала при содействии иезуитов мало-помалу осуществляться. Иезуиты, пропагандируя в Литве почти 20 лет идею унии, своими проповедями, диспутами с православными, своими школами и особенно своими сочинениями успели достаточно ознакомить православных людей с понятиями о подготавливающейся унии. Действуя указанными путями, они многих православных поколебали в вере, иных склонили к латинству, других предрасположили к унии льстивыми обещаниями, а самое главное — успели приобрести настолько сильное влияние на своего питомца и ставленника короля Сигизмунда III и его правительство, что тот под их руководством готов был употребить все меры, лишь бы насадить унию в своем государстве. Оставалось только подыскать среди православных епископов таких лиц, которые согласились бы действовать по их указке. И это им вскоре удалось.
Подготовке унии в сильной мере содействовало тогдашнее положение Западно-Русской Церкви, далеко не соответствующее каноническим уставам. В среде духовенства немало было лиц, не имевших права занимать высшие церковные должности. Сам Киевский митрополит Онисифор Девочка был двоеженец, ибо до рукоположения своего в духовный сан был вдовцом после смерти второй жены, и посему не мог быть лицом духовным. К тому же он оказался весьма небрежным пастырем и слабым защитником своего духовного стада, как это видно из письма галицко-русских дворян, посланного ему в 1585 г. из Варшавы. «Хотя Вашу милость старшим своим имеем, — писали Онисифору дворяне, — однако Ваша милость не заботился о том, чтобы словесных овец своих от губительных волков оборонять. Во время пастырства Вашей милости довольно всего злого в нашем законе осталось: насилие святыни, замыкание Святых Таин, запечатание церквей, запрещения звонить, выволакивание от престола и от церквей Божиих попов, и, как будто бы злодеев, сажают их в тюрьмы, а мирским людям запрещают в церквах Божиих молиться... Но этого мало: рубят кресты святые, захватывают колокола в замок (крепость), отдают их в распоряжение жидам, и еще, Ваша милость, листы свои открытые против церквей Божиих жидам на помогу даешь... Но что еще хуже, Ваша милость, поставляешь одних епископов без свидетелей и без нас, братии своей, что и правила запрещают, вследствие чего негодные люди становятся епископами» и проч.
В 1588 г. проездом в Москву Литву посетил Константинопольский Патриарх Иеремия. Князь К.К. Острожский обратился к нему с просьбой привести в порядок Западно-Русскую Церковь. Поэтому Иеремия на обратном пути снова заехал в Литву (1589). Здесь его приняли весьма торжественно и радушно, и только вступивший тогда на престол при помощи иезуитов король Сигизмунд III (1587—1632) по просьбе князя Острожского дал Патриарху окружную грамоту, которой подчинил ему всех духовных лиц и дела Западно-Русской Церкви. Патриарх сместил всех двоеженцев и троеженцев с занимаемых ими церковных мест, установил на будущее время порядок замещения архиерейских кафедр монахами и предоставил большую силу братствам. В числе смещенных были Киевский митрополит Онисифор Девочка и Супрасльский архимандрит Тимофей Злоба, обвиненный в тяжких преступлениях. На место Онисифора был избран Минский архимандрит Михаил Рагоза. Патриарх по настоянию короля Сигизмунда III посвятил его, но, не доверяя ему, назначил своим экзархом, т.е. наместником, успевшего понравиться ему Луцкого епископа Кирилла Терлецкого, которому предоставил право надзора и суда над западно-русским духовенством. Митрополит, конечно, был этим очень огорчен и явно высказывал свое недовольство. В числе недовольных были также епископы Холмский Дионисий и Пинский Леонтий, которые явились защитниками запрещенных Патриархом двоеженцев и троеженцев священников. Не угодил Патриарх и Кириллу Терлецкому, так как принимал на него жалобы, а перед отъездом в Грецию издал неприятное для него распоряжение, чтобы митрополит созвал духовный Собор для устранения всяких непорядков в Церкви и для суда над недостойными иерархами, в числе которых оказался и Терлецкий, обвинявшийся в тяжких преступлениях. Но особенно был настроен против Патриарха Львовский епископ Гедеон Балабан, так как Львовское братство, с которым он давно находился во враждебных отношениях, было признано Патриархом вполне независимым от епископа. Не только Гедеон, но и все епископы недовольны были некоторой зависимостью от Патриарха и расширением прав братств. «Как, — говорили они, — какой-нибудь сходке ремесленников, седельников, кожевников, неучам в вере дать право составлять приговоры о делах Церкви?»