21 ноября 1995 года Президентом Кыргызской Республики А.Акаевым был подписан Указ "О неотложных мерах по усилению борьбы с незаконным оборотом наркотиков". По согласованию с директором ФПС Российской Федерации генералом армии А.Николаевым на Группу пограничных войск Российской Федерации в Кыргызской Республике возлагалась задача осуществления пограничного контроля на таджикско-киргизской границе в части пресечения транзита наркотических средств. Это, в свою очередь, способствовало исполнению российской Федеральной целевой программы "Комплексные меры по противодействию злоупотреблениям наркотиками и их незаконному обороту на 1995-1997гг.", принятой 3 июня 1995 года. Указом Президента КР от 21 ноября 1995 года Группе пограничных войск РФ в Кыргызской Республике было предоставлено право заниматься в зоне ответственности вдоль линии административной границы с Республикой Таджикистан и оперативно-розыскной деятельностью.
В рамках реализации данного Указа, уже в декабре 1995 года в тяжелых условиях зимы, военнослужащими Группы пограничных войск РФ на линии административной границы Республики Кыргызстан с Республикой Таджикистан (трасса Ош-Хорог) были развернуты 4 пограничных заставы и спецкомендатура на базе погранзаставы "Сары-Таш".
Результаты деятельности Группы пограничных войск Российской Федерации в Республике Кыргызстан в этом направлении стали очевидны очень быстро. Так, в период с июля по декабрь 1995 года военнослужащими Группы пограничных войск Российской Федерации было пресечено 22 попытки ввоза в республику наркотических средств. Особенно динамичной статистикой отличался пост "Сары-Таш": 20 июня 1996 года у гражданина Таджикистана изъято 35 килограммов опия; 5 июля 1996 года в тайнике, - двойном дне кузова автомашины, прибывшей из Хорога, обнаружено 90 килограммов опия; 23 июля изъято 70 килограммов опия; 1 августа из автомобильного бензобака извлечено 3 килограмма опия-сырца; 6 августа в тайнике в автомашине ЗИЛ-130 обнаружено 2 килограмма опия-сырца.
Анализируя сложившуюся практику и результаты противодействия незаконному обороту наркотиков, нельзя не обратить внимание, что между ГПВ РФ и правоохранительными структурами КР постоянно присутствовали сотрудничество и взаимодействие. Отдельные же факты трений свидетельствуют о том, что рост наркобизнеса влечет за собой и рост преступлений вообще, в том числе - связанных с коррупцией.
В борьбе с афганским наркотрафиком сразу же было установлено тесное взаимодействие с правоохранительными органами, в частности, с УБН МВД, которому, как правило, передавался изъятый наркотик для приобщения к уголовному делу и последующего уничтожения. Пограничный контроль помимо высокогорной автотрассы Ош - Хорог осуществлялся также вдоль всей кыргызско-китайской госграницы, на трех контрольно-пропускных пунктах: в столичном аэропорту "Манас", "Ош-аэропорт" и "Торугарт". За год (с июля 1995 по июль 1996) российские пограничники пресекли 22 попытки ввоза в Кыргызстан наркотических средств, задержали 23 наркотрафиканта, конфисковав у них более тонны наркотиков. Около 70% конфискованного афганского героина и опия-сырца было изъято на памирском направлении, в основном на заставах "Сары-Таш", "Кызыл -Арт".
Командующий ГПВ России в Кыргызстане генерал-лейтенант П.Васько, подчеркивал: "Оперативные данные свидетельствуют, что поток наркотиков из Афганистана будет возрастать в ближайшие годы... Военнослужащие Группы российских погранвойск в Кыргызстане делают все возможное для противодействия наркодельцам".
Подобная активность пограничников вызывала и противодействие. Как отмечено в предыдущих главах, в тот период транзит наркотиков по Памирскому тракту Ош - Хорог был взят под контроль организованными международными криминальными группировками. Перевозка небольших партий наркотиков в условиях тяжелой социально-экономической ситуации являлась источником доходов широких слоев населения как Горно-Бадахшанской Автономной области Таджикистана, так и Ошской области Кыргызстана. Недовольство среди населения было использовано криминальными структурами. Одним из способов противодействия ГПВ РФ была дискредитация ее деятельности по самым разным поводам. К примеру, американская "Нью-Йорк Таймс" писала летом 1995 года о предвзятости российских военнослужащих по отношению к пересекающим зону контроля автомашинам, направляющимся из Хорога в Ош.