Первый раз над территорией Японии «Суперкрепости» появились ночью 15 июня 1944 г. Их целью был сталелитейный завод в Явата — единственная «стоящая» цель, до которой В- 29 могли долететь из Ченду (Китай), неся при этом всего по паре тонн бомб 1*. До цели добрались 61 бомбардировщик из 68 взлетевших, шесть машин были потеряны в результате аварий и от зенитного огня, и лишь одна «крепость» была сбита сержантом Садамацу Кимура из 4-го сентая, вооружённого двухмоторными истребителями Ки.45 «Торю», (всего пилоты 4-го сентая претендовали на семь сбитых и шесть повреждённых бомбардировщиков) Однако результаты налёта были просто смехотворными, так как нанесённые повреждения были полностью ликвидированы в течение нескольких дней без остановки завода и снижения темпов производства, куда более сильным оказался психологический удар, нанесённый по японскому обществу. Если рейд Дулиттла считался, и вполне обоснованно, досадной случайностью, частной диверсией, то налёт В-29 на Явату предвещал систематические сокрушающие удары в самое ближайшее время. Впрочем, американцы, испытывающие большие сложности с доставкой предметов снабжения для «Суперкрепостей» в Китай, не особенно усердствовали в налётах, которые были предприняты лишь в ночь на 8 июля и 11 августа.
Большой разброс по времени между первыми налётами В-29 позволил японцам более тщательно готовиться к отражению каждого последующего рейда американцев. Были реорганизованы посты ВНОС, проложены линии связи, пилоты истребителей ПВО армии и флота имели возможность лучше подготовиться к ночным перехватам.
Настоящий ад для Японии начался после сооружения на захваченных островах Сайпан и Тиниан аэродромов, способных принимать «Суперкрепости», с чем значительно упрощались проблемы снабжения крупных бомбардировочных соединений. Первый налёт на военные объекты в районе Токио, которому предшествовали несколько вылетов разведчиков F-13, был совершён американцами 24 ноября. Был сильно разрушен завод фирмы «Накадзима», что вызвало падение производства примерно на 50 %. 29 ноября «Сверхкрепости» бомбили жилые кварталы Токио, уничтожив примерно 25.000 домов, число погибших составило около 10.000 человек, ещё 15.000 осталось без крова.
Бомбардировщики, «работающие» с Сайпана, применяли несколько иную тактику, нежели летавшие из Китая, перейдя к дневным налётам, что позволяло более тщательно произвести прицеливание, а также перешли от «точечного» к «ковровому бомбометанию», методично засыпая цель бомбами небольших калибров. Поскольку с появлением «Суперкрепости» законы физики, в том числе и законы рассеивания, никто не отменял, то высота бомбометания была несколько снижена. Теперь шедшие на высоте порядка 8–9 тыс. м бомбардировщики были более уязвимы от атак японских перехватчиков, но расчёт делался, причём, весьма обоснованно, на мощь оборонительного вооружения и сохранение плотного строя. Правда, одновременно возросло и количество японских перехватчиков, так как в дневное время можно было задействовать гораздо больше одномоторных истребителей, нежели ночью или в сумерках.