Из Лемберга Хмельницкий двинулся со своими войсками в сторону Варшавы, где в это время происходили выборы нового короля. Выбор пал на Иоанна Казимира, брата Владислава IV, бывшего примасом Гнесенского и кардиналом (1648-1668). Новый король вступил в мирные переговоры с предводителем повстанцев гетманом Хмельницким. Но из-за чрезмерных требований казаков переговоры были сорваны, и в результате весной 1649 г. вновь вспыхнуло пламя гражданской войны, сопровождавшееся уничтожением еще многих еврейских общин. После череды сражений, в которых поляки потерпели поражение, между Иоанном Казимиром и Хмельницким в городе Зборов был заключен мирный договор. В этот договор, выгодный для казаков, был включен пункт, запрещающий проживание евреев в части Украины, населенной казаками, в областях Черниговской, Полтавской, Киевской и отчасти Подольской (август 1649 г.).
Наконец евреи, после полутора лет страданий и пыток, вздохнули с облегчением. Тем из них, кто перед смертью принял греческую православную веру, король Иоанн Казимир разрешил вернуться к своей старой вере. Насильно крещеные еврейки в большом количестве бежали от своих мужей-казаков и вернулись в свои семьи. Совет Четырех Земель, собравшийся в Люблине зимой 1650 г., разработал ряд постановлений, направленных на восстановление нормальных условий в домашней и общественной жизни евреев. День Немировской резни (20 сивана), совпавший со старинным постом в память мучеников крестовых походов, был назначен днем траура, в память о жертвах казачьего мятежа. Ведущие раввины того времени составили ряд волнующих душу панихид и молитв, которые читались в синагогах в роковую годовщину двадцатого Сивана.
Но передышка, предоставленная евреям после этих страшных событий, длилась недолго. Зборовский договор, не удовлетворивший польское правительство, им не был выполнен. Взаимная неприязнь вызвала новые столкновения, и в 1651 г. вновь вспыхнула гражданская война. Польское правительство созвало народное ополчение, в состав которого входил тысячный еврейский отряд. На этот раз народное войско одержало верх над войсками Хмельницкого, в результате чего был заключен выгодный полякам мирный договор. По Беловскому договору Церкви, заключенному в сентябре 1651 г., многие притязания казаков были отклонены, а право евреев жить в греко-православной части Украины было восстановлено.[47]
В результате вновь восстали казаки и греко-православные украинцы. Богдан Хмельницкий вступил в переговоры с русским царем Алексеем Михайловичем о включении на правах автономной провинции греко-православной части Украины под названием Малороссии в состав Московской империи. В 1654 году произошло это присоединение, и в том же году русское войско двинулось на Белоруссию и Литву для войны с Польшей. Теперь пришла очередь евреев северо-западного региона терпеть свою долю страданий.
3. Русское и шведское нашествия (1654-1658 гг.)
Союз их врагов, казаков, с правителями Московии, страны, которая всегда испытывала суеверный страх перед людьми других земель и религий, был чреват неисчислимыми бедствиями для евреев. Теперь настала очередь жителей Белой Руси и Литвы столкнуться с полчищами южных и северных скифов, которые вторглись в доселе щадящие их области, опустошая их непрерывно в течение двух лет (1654-1656). Захват основных польских городов объединенными войсками москвичей и казаков сопровождался истреблением или изгнанием евреев. Когда Могилев на Днепре сдался русскому оружию, царь Алексей Михайлович удовлетворил просьбу местных русских жителей и отдал приказ изгнать евреев и разделить их дома между магистратом и русскими властями (1654 г.). Однако евреи, надеявшиеся на скорейшее прекращение боевых действий, не смогли покинуть город сразу, за что пришлось жестоко поплатиться. В конце лета 1655 г. командующий русским гарнизоном в Могилеве полковник Поклонский узнал о приближении польской армии под командованием Радзивилла. Опасаясь, что еврейские жители могут присоединиться к приближающемуся врагу, Поклонский приказал евреям покинуть пределы города и, на основании того, что они являются польскими подданными, пообещал перевести их в стан Радзивиллов. Едва евреи в сопровождении своих жен и детей и с их имуществом покинули город, как русские воины по команде того же Поклонского напали на них и убили почти всех, разграбив их имущество. в то же время.
В Витебске евреи принимали активное участие в защите города от осаждавших его русских войск. Они рыли траншеи вокруг укрепленного замка, укрепляли стены, снабжали воинов оружием, порохом и лошадьми, действовали как разведчики. Когда город был окончательно взят русскими, евреи были полностью ограблены запорожскими казаками, а многие из них взяты в плен, насильственно крещены или сосланы в Псков, Новгород и Казань.