Самуйлович исходатайствовал у Государей прощение Григорию Дорошенку, содержащемуся в Москве под стражею за сделанные ему неудовольствия. Поляки вооружали против него Малороссиян; Государи предостерегали его от угрожавшей опасности; Сейм Варшавский подсылал к нему убийц. Поддерживаемый Шереметевыми, из которых один был женат на его дочери, Гетман женил сына своего, Якова, на дочери Русского Генерала Владислава Швыйковского, и настоял, с помощию Голицына, чтоб зятя его Шереметева сделали Киевским Воеводою.
Но гроза собиралась над ним; она началась потерями невозвратными: в Марте лишился он дочери своей, Шереметевой; в Июне сына, Стародубского Полковника, как подозревают, отравленного. Похоронив обоих в Киево-печерской Лавре, Гетман писал к П етру: «Сын мой любимый, старший, надежда моей старости, скончал живот свой, а с ним погас светильник утехи моей.» С ответом Государи прислали к нему лекарств и доктора Фон-дер Гульшта. А между тем он уже отогревал змею за пазухою: Иван Мазепа был уже Генеральный Асаул.
Цесарь и Король уверясь, наконец, что, без пособия Царей, не могут ни в чем успеть против Турков, приступили к вечному миру с Россиею. Узнав о том, Гетман отправил сына своего Григория с Мазепою в Москву; Цари спросили Гетманского мнения. Он отвечал следующее: «Польша, при заключении вечного мира, наверно пожелает обратить оружие Российское против Турков и Татар, для завоевания Крыма. Тогда вся тяжесть войны обрушится на Россию, и войска Царские одне потерпят в диких и безводных Крымских степях. Россия не может истребить Татар; они найдут притон и вне полуострова; а во время Крымского похода, Турки, вероятно, вступят в Польшу; Поляки, вероятно, заключат с ними мир, и тогда война можете быть внесена в Россию. Если Польша потребует козаков для вспоможения, то потом козаки западные станут ссориться с восточными, а правительство Польское интригами, подговорами и подкупами, по обыкновению своему, может отдалить от Государя всю Малороссию; лучше, удовлетворить Короля деньгами, стараться об удержании западной Украйны и Запорожья, защищать церковь от внесения Унии, возвратить монастырям и Метрополии отторженные Поляками маетности; в случае потери Заднеприя, распространить, по крайней мере, область Киевскую, снабдить Киев сильнейшим гарнизоном и, что еще лучше населить его военными людьми женатыми. Наконец, иметь всегда строгий надзор над Калмыками и Донцами, потому что Коронный Гетман хвалится их пособием».
Совет был мудрый, дальновидным; мыслью о поселениях, он предупреждал век свой целым столетием; но этим советом Россия не воспользовалась. Еще Петр не управлял ею самодержавно, еще он боролся с Софиею, — с ее любимцами, со Стрельцами, с невежеством, и вечный мир с Поляками был заключен в Москве. Условия не совсем были сходны с мнением Самуйловича.