В декабре 1402 г. войска самаркандского эмира Тимура захватили Смирну, практически уничтожив город. Это было опасное соседство. Через год, в 1403 г., родосскими рыцарями был подписан договор с мамелюкским Египтом, направленный против Тимура. В это же время иоанниты восстановили в Иерусалиме свой госпиталь. Мир с Египтом продолжался почти 20 лет. В 1424 и 1425 гг. флот египетского султана атаковал Кипр, и, в конце концов, в 1426 г. остров был захвачен. А в 1440 г. мамелюки появились уже у самого Родоса.
Борьба с мамелюкским Египтом
В 1440 г. 18 галер египетского султана Якмака аз-Захира атаковали Родос. Рыцари отбросили египтян.
"Султан под видом, что будто бы Родос в древние времена зависел от Египта, положил твердое намерение напасть на оной, для чего вооружив флот, состоящий из восемнадцати галер и под командой египетского адмирала, послал его для завоевания Родоса. Адмирал начал войну сию нападением на принадлежащий Ордену остров Шатору, которым и овладел. А затем обратился к Родосу, куда и прибыл 25 сентября 1440 г. Кавалеры, возбуждаемые примером Великого Магистра, вооружась, сопротивлялись высадке неверных. Маршал же Ордена, командовавший флотом, вышел из гавани, и хотя орденский флот был гораздо в меньшем количестве, нежели неприятельский, но маршал решился вступить в сражение с неверными, кои принуждены были отступить. Маршал, приблизившись к неверным, сразился с ними. Сражение сие продолжалось целый день, пока ночная темнота принудила всех разделиться. Победоносные кавалеры, потеряв не более 70 человек, возвратились в Родос, неверных же потеря простиралась до 700 человек" [91].
В 1444 г. рыцари снова отбились от египтян после 40-дневной осады восемнадцатитысячная армия мамелюков осадила столицу Родоса, а флот блокировал гавани - но неоднократные штурмы удачи египтянам не принесли.
"Султан из досады клялся разорить Родос. Великий Магистр, вновь укрепив остров, приготовился к обороне, но едва успел окончить свои укрепления, как вдруг появился пред Родосом неприятельский флот. Начальник оного, высадив на остров 18.000 пехоты, не считая конницы и мамелюков, приблизился к столице и осадил оную, а флот между тем облег гавань. Осада продолжалась 40 дней. Неприятели, дабы овладеть городом, хотя делали много приступов, но наконец отражены храбростию кавалеров и принуждены были сев на суда удалиться" [91].
В 1448 г. мамелюки подписали мирный договор с Сувереном Родоса.
Война с Оттоманской Портой
В 1453 г. в результате длительной осады и штурма войска турецкого султана Мехмеда II взяли Константинополь. Государство иоаннитов на Родосе осталось последним их противником в Восточном Средиземноморье. Через год Мехмед II потребовал от иоаннитов уплаты дани - 2000 дукатов ежегодно.
"Магомед возгордясь сим завоеванием отправил к Великому Магистру посла со строгим предложением о признании его владетелем Родоса и требовал от Ордена 2000 червоных ежегодной дани. Великий Магистр с согласия Совета отвечал ему, что корпус Ордена состоит из военных монахов, кои зависят частью от христианского первосвященника, что остров Родос приобретен кровью кавалеров и что еще ни один государь не требовал такового признания, и Орден с радостью готов посвятить жизнь свою на защищение христианского закона.
Магомед объявил войну Ордену, клялся разорить Родос и немедленно послал к Родосу 30 галер, кои опустошили берега многих орденских островов.
Султан турецкий приказал вооружить 30 галер, на кои посадив довольное число пехоты, повелел начальнику оных делать высадки на остров Родос, разорять оной и похищать жителей. Вскоре после сего у острова появились неприятельские галеры, о коих прибытии узнав кавалеры, дали войскам сойти на берег и сделав на них сильное нападение, великое множество побили, некоторых в плен взяли, а остальных принудили сев на суда удалиться" [91].
К 1467 г., готовясь к турецкому нашествию, иоанниты построили на Родосе много новых укреплений - были выкопаны рвы и сооружена стометровая стена со стороны моря высотой до 10 метров.
Великий Магистр Пьер д'Обюссон
В 1479 г. турецкому султану было отправлено письмо Великого Магистра Ордена иоаннитов француза Пьера д'Обюссона, потребовавшего от Турции прекратить нападения на орденские земли. В ответ на это смелое требование 23 мая 1480 г. семидесятитысячная турецкая армия во главе с греческим ренегатом Мануилом Палеологом (Меши-пашой) попыталась захватить Родос. Турецкий десант высадился в заливе Трианда и атаковал центральный пункт обороны родосской крепости - форт Сант-Николас, применив осадные орудия. Более 600 рыцарей всех восьми "Языков" прибыли защищать резиденцию Ордена. Решающий штурм турок, во время которого Великий Магистр получил пять ран в бою в проломе стены, был отбит иоаннитами 27 июля. Родосские рыцари стали посылать брандеры, которые поджигали турецкие галеры. 17 августа турки ушли, превратив Родос в груду развалин.