Если же кого осуждали на казнь, то в указе не было имени Годунова, но писали: «Приговорили бояре, князь Федор Иоаннович Мстиславский с товарищами». По этой хитрости можно судить и о всех других хитростях, какие употреблял Борис, чтобы вкрасться в любовь ко всем Русским. Использование таких средств не могло не увенчаться успехом, особенно с того времени, как он подкрепил свою власть новой опорой: зная набожность нашего народа и его глубокое уважение к служителям Божиим, Годунов предложил царю возвысить Русское духовенство учреждением патриаршеского достоинства. Имя патриархов означало главных пастырей церкви, и такие были только в пяти знаменитейших городах: Риме, Александрии, Антиохии, Иерусалиме и Константинополе. С этим высоким званием, конечно, соединялось и больше власти, чем с обыкновенным достоинством митрополита, особенно в правление Федора, посвятившего всю свою жизнь молитвам. Борис знал все это, знал, кого сделать патриархом, и потому предложил об этом учреждении Федору.
Как он ожидал, так и сделалось: царь согласился с удовольствием; духовенство и народ с радостью приняли новое звание; первому оно обещало лестные отличия, второму казалось особенной Божией милостью. В Москве был в то время Константинопольский патриарх Иеремия; он посвятил в достоинство Русского патриарха митрополита Иова, одного из преданнейших друзей Годунова. Благодарный за свое возвышение, Иов начал с того времени еще усерднее служить своему покровителю.
Таким образом, все исполнилось по желанию правителя. Его неограниченная власть, поддерживаемая самим государем и всем духовенством, казалась для народа священной, как будто происходившей от Бога, и еще при жизни Федора все думали, что никто другой, кроме брата царицы, не может быть наследником престола. Властолюбивый Борис, видя такое расположение умов, с нетерпением ожидал счастливого дня, когда с его царским могуществом соединится и имя царя. Этот день настал 6 января 1598 года. Федор опасно занемог и на другой день скончался. Народ, любя этого кроткого сына незабвенной Анастасии за его благочестие и набожность, за его щедрость и милосердие к бедным, забывал его слабости, искренно плакал по нем и, исполняя его волю и совет Бориса, присягнул царице Ирине, несмотря на то, что печальная государыня с первой минуты кончины своего нежного супруга, решилась постричься в монахини. Годунов знал это, но для него нужно было, чтобы Русские поклялись в верности его сестре. Эта клятва еще более приближала его к престолу, и когда через девять дней Ирина постриглась, пламенное желание ее брата исполнилось: вельможи, духовенство и народ поднесли ему Русскую корону!