Узнав это, члены суда ужаснулись от мысли о том положении, в какое могла попасть Россия при удачном исполнении этих замыслов, и благодарили Бога за их разрушение. И бывшая царица, и царевна Мария были преданы суду. Первую, просившую супруга о помиловании, сослали в Новоладожский монастырь; вторую заключили в Шлиссельбургскую крепость. Главные сообщники, склонившие их и царевича к заговору, Ростовский епископ Досифей, генерал-майор Глебов и служившие при Алексее Петровиче Кикин и Вяземский были казнены. После этой казни приступили к осуждению важнейшего преступника, того, кто был виновен перед государем не только как подданный, но и как сын. По всем церковным законам, очень строгим в этом отношении, и гражданским, которые с величайшей точностью согласовывались со священным писанием, виновный царевич был достоин смерти. Духовные судьи предоставляли отдать решение на волю царя: перечислив примеры и строгого правосудия из Ветхого Завета, и милосердия, и прощения
Новый Завет — второй раздел Библии (Священного Писания), состоящий из четырех канонических Евангелий (Евангелия от Марка, Евангелия от Матфея, Евангелия от Луки, Евангелия от Иоанна), Деяний апостольских, 21 послания апостолов и Откровения Иоанна Богослова (Апокалипсиса).
Это решение прочтено было царевичу в Сенате, перед всеми его членами и судьями и произвело такое сильное впечатление на несчастного, не имевшего от природы и малейшей части той героической твердости, которая отличала его родителя, что почти в ту же самую минуту он упал в продолжительный обморок, и все старания искусных докторов едва могли привести его в чувство, и то ненадолго. Томительный суд, продолжавшийся пять месяцев, и мучительные ожидания решения, вероятно, истощили силы виновного: опомнившись от сильного обморока, он жил только несколько часов и скончался в тот же день, получив прощение и благословение своего родителя, забывшего в ужасную минуту этой кончины все преступления виновного сына.
Это было 26 июня 1718 года. Три дня тело умершего было выставлено для народа в Троицкой церкви и 30 июня погребено в Петропавловском соборе.
Так горестный государь лишился своего старшего сына, жестоко обманувшего приятные ожидания и надежды отеческого сердца. Утешением Великого и объявленным наследником престола остался теперь маленький царевич Петр Петрович.
Мир со Швецией и Петр император
Недолго это утешение радовало сердце Петра: 25 апреля 1719 года царевич скончался на четвертом году своей жизни. Этот неожиданный удар сильно поразил государя, потерявшего последнюю надежду передать судьбу своего народа родному наследнику! Но много было твердости в этой героической и в то же время благочестивой душе! Отдав милого младенца небесному Отцу, Петр вместе с ним передал Богу и будущую судьбу России. Усердная молитва успокоила страдания государя до того, что он уже без убийственного уныния мог видеть все приготовления к выносу тела царевича из дворца, мог даже сам проводить его до места погребения в Невском монастыре. Его душевные силы были еще удивительнее: в эти горестные дни он мог, как обычно, заниматься государственными делами. Правда, в то время они были очень важны и требовали особенного внимания царя: Швеция лишилась своего короля-героя, и новые опасности угрожали России.