С 17 по 19 марта 1979 г. шло заседание Политбюро по вопросам положения в ДРА. Лейтмотивом этого совещания стала фраза: «Мы ни при каких условиях не можем потерять Афганистан. Вот уже более 60 лет мы живем с ним в мире и добрососедстве. И если сейчас Афганистан мы потеряем, он отойдет от Советского Союза, то это нанесет сильный удар по нашей политике». На заседании 18 марта обсуждался вопрос о вводе войск в Афганистан, но было принято отрицательное решение. Председатель КГБ СССР Ю. В. Андропов и министр иностранных дел СССР А. А. Громыко высказались против данной акции, мотивируя это тем, что в ДРА нет пролетариата, слабо развита экономика и «страшное засилие религии», советские войска вынуждены будут воевать со всем народом и превратятся в агрессора, а политических выгод от этого не просматривается практически никаких. 19 марта на заседании Политбюро присутствовал Брежнев, одобривший принятые решения. Брежнев велел сообщить Тараки, что он должен ликвидировать кризис силами самих афганцев (РГАНИ. Ф. 89. Перечень 25. Док. 1).
Тараки принял это указание. Жесткими мерами с применением авиации за два дня мятеж был подавлен. Погибло, по различным сведениям, от 3 до 30 тысяч человек. 20 марта Тараки прибыл в Москву, где встретился с Косыгиным и членами Политбюро. Ему официально было сказано, что надо укреплять авторитет собственного руководства, а не надеяться на военную помощь СССР.
Между тем влияние Тараки все более падало, а власть в стране прибирал к рукам Амин. Оппозиция продолжала наступление. 25 марта правительственные войска оставили город Бала Муграб, бои шли в районе Джелалабада и в Кунарской долине. На сторону повстанцев стали переходить части афганской армии. Так, под Гардезом на сторону моджахедов перешел 59-й полк. К июлю 1979 г. Кабул контролировал лишь 5 провинций из 28. В Афганистан последовательно совершили визиты начальник Политуправления ВС СССР Епишев и командующий сухопутными войсками Павловский. Резко увеличивается число военных советников: к декабрю 1979 г. их стало более 5 тысяч. Только в 1979 г. ДРА было поставлено 200 танков Т-54, 900 – Т-55 и 100 – Т-62.
1 сентября 1979 г. Тараки вновь приехал в Москву после посещения Кубы. Состоялась встреча с Брежневым. Тараки было рекомендовано устранить Амина, об интригах которого стало известно по линии КГБ. Брежнев усиленно повторял, что партию раскалывать нельзя. 11 сентября Тараки вернулся в Кабул, где его на аэродроме встретил Амин. 16 сентября Тараки по приказанию Амина был отстранен со всех своих постов, обвинен в попытке покушения на последнего и задушен офицером президентской гвардии. Убийство Тараки было ударом по престижу Брежнева: ведь он поддерживал Тараки. Однако утром 17 сентября Брежнев и Косыгин поздравили телеграммой Амина как нового Генерального секретаря ЦК НДПА. Амин же начал физически уничтожать своих политических противников. К 27 октября насчитывалось более 11 тысяч казненных по его приказу людей.
Хотя Амин подчеркивал, что действует «по-сталински» (портрет Сталина висел в его кабинете), представители КГБ из Кабула сообщали, что Амин может «изменить» СССР с американцами, как до этого сделал в Египте Садат. К этому времени положение на Среднем Востоке резко обострилось: в ответ на захват в Иране американских дипломатов США начали стягивать силы в Персидский залив. Советский Генеральный штаб не исключал, что американцы попытаются захватить Афганистан и превратить его в свою базу. Под впечатлением этих фактов многие члены Политбюро стали менять свое первоначальное мнение о целесообразности ввода войск в ДРА. 3 ноября вернувшийся из Афганистана генерал армии Павловский заявил министру обороны Устинову, что без советской помощи кабульский режим не выживет, т. к. ряды оппозиции насчитывают уже более 100 тысяч человек и всё более растут. К декабрю 1979 г. Андропов, Громыко, Устинов, Суслов и Пономарев считали ввод советских войск в Афганистан полностью оправданным. Андропов направил Брежневу записку, в которой предупреждал о возможной «измене» Амина и писал, что в этом случае вся Средняя Азия и Казахстан окажутся под прицелом американских ракет.
На совещании у министра обороны представители Генерального штаба – маршал Огарков, генерал армии Ахромеев и генерал армии Варенников высказывались против ввода войск, так как, по их мнению, это только усилит оппозицию. Но Устинов и Андропов не согласились с этим мнением военных.