Были усилены контрольные функции государства на выборах, что способствовало усилению позиции партии власти – «Единой России», возникшей в результате слияния блоков «Единство» и «Отечество – Вся Россия». Триумфом для «Единой России» завершились выборы в Государственную Думу в конце 2003 г.: ее фракция, после того, как к ней примкнули независимые депутаты, составила 305 человек и тем самым получила конституционное большинство (более 2/3 Думы). В то же время в Думу впервые не смогла пройти ни одна из оппозиционных либеральных партий, а лидеры левых – коммунисты – получили чуть более 12 % голосов. Партия «Единая Россия», фактически подконтрольная Администрации Президента, неизменно декларировала полную поддержку президентского курса, что гарантировало одобрение всех инициатив главы государства в высшем законодательном органе.
Серьезными политическими нововведениями сопровождался второй срок пребывания В. Путина у власти (2004–2008 гг.). По степени важности это были следующие реформы: 1) избрание губернаторов не на основе волеизъявления всех избирателей, как было раньше, а путем голосования законодательных собраний территорий по кандидатуре, предложенной Президентом России; 2) введение исключительно пропорциональной системы выборов в Государственную думу по партийным спискам вместо прежней смешанной системы; 3) повышение избирательного порога для прохождения политических партий в Государственную думу с 5 до 7 %; 4) отмена порога явки избирателей на выборы (прежде выборы являлись действительным при явке на президентские выборы не менее 50 %, в Государственную думу – 25 %, в местные органы власти – не менее 20 % избирателей).
Оппозиция справедливо оценила эти реформы как «свертывание политической демократии в России». Представители президентской стороны отстаивали тот тезис, что демократия не имеет шаблонов, по этой причине отклонения от западной модели не могут рассматриваться как отход от принципов демократии. Ими была выдвинута концепция
Второе направление политических преобразований В. Путина – отстранение олигархов от власти. Формулируя свою принципиальную позицию, Президент указывал, что «так называемые олигархи… которые стали миллиардерами, как у нас говорят, в одночасье… прекрасно поняли, как можно манипулировать общественным мнением, и, по сути, так же, как поступали с природными ресурсами, начали поступать и со средствами массовой информации, и с общенациональными каналами телевидения, и так далее, подчиняя их своим групповым интересам, подменяя общенациональные интересы групповыми».
Первыми весной 2000 г. под удар были поставлены Борис Березовский и Владимир Гусинский, как и принадлежавшие им информационные империи. Генеральная прокуратура, возбудившая уголовные дела против двух олигархов, предъявила им конкретные обвинения, в первую очередь связанные с мошенничеством и преступлениями в ходе приватизации. Летом – осенью 2000 г. оба олигарха выехали из России, поставив себя в положение невозвращенцев. После этого подвластный Березовскому и самый влиятельный общероссийский телеканал ОРТ перешел под контроль государства, которое решительно поменяло его политику. Другой телеканал, НТВ, перешел под контроль подвластного государству «Газпрома», приобретшего контрольный пакет акций влиятельного СМИ. Эти меры обеспечили контроль президентской власти над самыми востребованными средствами массовой информации, быстро превратившимися в инструменты государственной пропаганды.