Вследствие целого ряда обстоятельств, таких как низкий общеобразовательный уровень, недостаточная твердость, прямодушие, неумение эффектно преподнести властям свою работу, что особенно ярко проявилось на фоне блестящего оратора и эрудита А. Я. Вышинского, М. И. Панкратьев не смог долго занимать высокую должность. Да и отношение работников органов прокуратуры было к нему не самое доброжелательное и уважительное.