Аббас-Мирза бежал в Казах, но казахские татары, еще недавно относившиеся недружелюбно к русским, увидя поражение персов, встретили их враждебно и, напав в Делижанском ущелье на армию Аббаса-Мирзы, нанесли ей окончательное поражение.
Карягин со спасенным им транспортом 30 июля возвратился в Елисаветполь, а 3 августа туда прибыл и Цицианов. Этим закончилась вторая персидская война в правление Грузией князя Цицианова, ознаменованная примером редкого мужества и геройского самоотвержения войск.
В то время, когда происходили описанные события на суше, Каспийская флотилия и десантные войска действовали у Гиляни. Но эти действия далеко не оправдали ожиданий главнокомандующего. Во главе гилянской экспедиции был поставлен генерал-майор Завалишин — человек очень осторожный, помощником у него был подполковник Асеев, опытный в военном деле и известный своей храбростью. Отряд был силою около 1300 человек при 4 орудиях. Целью экспедиции ставилось занятие городов Решта и Баку; первого — для устрашения Баба-хана, а второго — с целью подчинения его России, так как там предполагалось устроить порт, могущий служить убежищем нашим купцам.
23 июня флотилия приблизилась к Энзели, и войска без особого сопротивления заняли этот город. 1 июля был занят город Пери-Базар, и оттуда 5 июля двинулся к Решту отряд из 800 человек с 3 орудиями. 7 тысяч персов засели в узкой малопроходимой дороге за огородами, засеками и на деревьях. Под градом неприятельских пуль русские шли неустрашимо, но люди изнемогали от жары, трудности пути и из-за того, что пушки и тяжести пришлось тащить на себе, так как все лошади были перебиты. Пройдя 7 верст от Пери-Базара, Завалишин решил отступить и возвратился в Энзели.
С 14 июля началась страшная жара, солдаты заболели и к 21-му числу в отряде было уже более 500 человек больных. При таких обстоятельствах Завалишин перевел людей на суда и 26 июля отплыл сначала к Ленкорани, а затем к Баку, куда прибыл 12 августа. К концу августа Завалишин устроил полную блокаду Баку и овладел высотами, которые командовали над городом, но слух о приближении кубинского Шейх-Али-хана на помощь осажденным заставил его отойти от крепости, сесть на суда и отойти к острову Саро.
Узнав об этом, Цицианов приказал Завалишину снова двинуться к Баку. И, несмотря на свою изнурительную болезнь, главнокомандующий с отрядом из 1600 человек при 10 орудиях в конце ноября сам выступил из Елисаветполя на помощь Завалишину. Ненастное зимнее время и приступы изнурительной лихорадки, повторявшиеся несколько раз в день, ослабили здоровье Цицианова, но тем не менее главнокомандующий считал свое присутствие необходимым и не оставлял отряд. Его отряд пришел к Баку 30 января 1806 г. и расположился лагерем в урочище Нахар-Булах.
Явившись под стенами крепости, главнокомандующий написал Хуссейн-Кули-хану, требуя от него безусловной сдачи. На поставленное категорическое требование хан ответил, что сдает бакинскую крепость на дискрецию (т. е. на совесть или на волю главнокомандующего) и повергает себя со всем своим владением и народом в вечное подданство Всероссийской Империи.
Посланный с письмом от хана Абдул-Хуссейн-бек объявил Цицианову, что хан его с покорностью принимает все милости государя и на другой день передаст ключи крепости. Князь Цицианов утром 6 февраля 1806 г. в сопровождении конвоя из 200 человек под начальством подполковника Асеева приблизился к колодцу, находившемуся в полуверсте от крепости, и в сопровождении генералов Завалишина и Гурьева вышел вперед. Бакинские старшины подали ему хлеб-соль и ключи. Ссылаясь на то, что хан не приготовился к приему, старшины просили отложить свидание до другого дня. На это Цицианов ответил, что он пришел не для того, чтобы возвращаться, и если придет в другой раз, то уже с лестницами.
Для объявления последних слов главнокомандующий отправил в город князя Эристова. Вслед за тем из крепости выехал хан в сопровождении нескольких лиц своей свиты. Передав ключи от крепости князю, хан облобызался с ним и предложил сесть на намед (войлок). В знак почета, по азиатскому обычаю, Хуссейн передал Цицианову кальян, но лишь только последний взял его в рот, как один из приближенных хана Ибраим-бек выстрелил князю в затылок, другим выстрелом был убит и Эристов, сопровождавший главнокомандующего. Отрезав голову Цицианову, Ибраим поскакал в город и в тот же момент с крепостных стен был открыт огонь по нашему отряду, стоявшему у колодца. Войска отступили, не успев выручить тело своего главнокомандующего. Оно было зарыто у ворот крепости и только через 6 лет маркиз Паулуччи перенес его в Тифлис и положил в Сионском соборе, где был воздвигнут и памятник с надписями на русском и грузинском языках.
Лучшим же памятником князю Цицианову будет то, что в течение трехлетнего своего управления Кавказом, он присоединил к России Гурию, Мингрелию, Шурагельскую область, карабагское, шекинское, ширванское ханства, Ганжу, Дербент, Кубу и джаро-белоканских лезгин.