Смерть славного воина и выдающегося администратора была поводом к тому, что все восточные хищники подняли голову. Прежде всего имеретинский царь Соломон потребовал, чтобы из Имеретии были выведены русские войска, и прекратил им выдачу продовольствия. Затем эриванский хан захотел захватить Шурагель и подготовить поход Персии. Далее поднялись шекинский, ширванский и карабагский ханы, пригласив к себе для совместных действий лезгин. Казикумухский хан с царевичем Александром захотели захватить Ганжу. В Джаро-белоканском округе началось брожение.
После смерти Цицианова на Кавказе остались его сподвижники: Несветаев, Карягин, Котляревский. Первым пришел в себя генерал Глазенап, находившийся на Северном Кавказе. Он немедленно послал в Тифлис Троицкий полк, поручив ведение дела Несветаеву, а сам с отрядом вышел на Кумыкское плоскогорье, чтобы удерживать в повиновении весь Дагестан.
Замыслы эриванского хана разрушил полковник Симонович. В Шуше действовал Лисаневич, против которого двинулся 20-тысячная персидская армия. На помощь ему генерал Небольсин двинул Карягина с отрядом в 1100 человек.
Генерал Глазенап, усмирив дагестанцев, двинулся к Баку. На пути он подчинил Дербент, но дальнейшее его движение было остановлено вновь прибывшим на Кавказ генералом Гудовичем.
После Цицианова до Ермолова
После подло убитого Цицианова главнокомандующим был назначен граф Гудович, заслуженный кавказский ветеран. По прибытии на Кавказ Гудович нашел дела в очень затруднительном положении. Все Закавказье, сдерживаемое твердой рукой Цицианова, готово было восстать. Имеретинский царь Соломон бунтовал открыто. Персия собирала значительные силы, рассчитывая возвратить Ганжу, Карабаг и другие провинции, подпавшие под власть русских. Закубанские народы и кабардинцы, пользуясь отсутствием войск на линии, совершали дерзкие набеги на наши города и станицы.
Против возмутившихся карабагцев и шедших к ним на помощь персов был выслан отряд под начальством генерал-майора Небольсина. Несмотря на малочисленность своего отряда, Небольсин на Аскарани при Ханашинском ущелье разбил 20-тысячный отряд персов. Затем Гудович отправил Небольсина против шекинского хана, войска которого и были разбиты наголову. После отчаянного сопротивления столица ханства — Нуха — была взята штурмом. Хан бежал и был объявлен лишенным своих владений навсегда.
После взятия Нухи Небольсин, с одной стороны, а генерал-майор князь Орбелиани — с другой стали угрожать лезгинским владениям. 8 ноября Орбелиани запер все лезгинское войско вместе с аварской конницей в тесном Джарском ущелье и принудил их к полной покорности. Покорив силою оружия восставшие ханства, Гудович не сумел упрочить над нами власть, введя там русское управление, как это сделал Цицианов с Ганжею. Он нашел более полезным оставить правителей туземцев, и таким образом благоприятный момент слить все Закавказье под одной общей русской властью был упущен.
Покорением лезгин закончились в Закавказском крае военные дела 1806 г. Наступила суровая зима, и Гудович поспешил заключить перемирие с Персией, так как Турция уже объявила России войну и сосредоточивала на границе значительные силы.
Положение главнокомандующего в крае было весьма затруднительно: в своем распоряжении он имел только одну 20-ю дивизию, а между тем государь настоятельно требовал наступательных действий, чтобы отвлечь часть турецких сил от главного театра войны на Дунае. Оставив небольшой отряд Небольсина на персидской границе и полагаясь на преданность вновь поставленных ханов, Гудович двинул остальные войска в турецкие пределы. Неудачная в начале кампания закончилась, однако, 18 июня 1807 г. полной победой над анатолийской турецкой армией на берегах Арпачая, невдалеке от селения Гумри.
Между тем переговоры о мире с Персией шли так медленно и неуспешно, что Гудович решил воздействовать на персов вновь оружием. С этой целью в начале сентября 1808 г. фельдмаршал вступил через Бамбакское ущелье в пределы эриванского ханства. Эчмиадзинский монастырь был занят без боя, и русские войска обложили Эривань. Одновременно с этими действиями Небольсин двинулся с 3-тысячным отрядом для покорения нахичеванского ханства. Несмотря на то что он там столкнулся с 25-тысячной армией Аббас-Мирзы, он нанес 28 октября персам решительное поражение. Разбитый Аббас-Мирза оставил Нахичевань без защиты, и Небольсин немедленно занял ее.
Эриванская крепость продолжала упорно защищаться. Между тем наступила ранняя суровая зима, глубокие снега завалили ущелья и совершенно прервали сообщения с Грузией. Эти обстоятельства, а также развитие болезней в лагере и недостаток боевых припасов, вынудили Гудовича решиться на штурм Эривани.