Для честолюбивого Бетлена Микуловский мир не был препятствием для возобновления военных действий против Фердинанда II. В 1623 г. в качестве союзника Фридриха Пфальцского и германских протестантских государей он предпринял новую военную кампанию. В течение месяца Бетлен оккупировал Словакию и в начале ноября окружил имперские войска в укрепленном лагере близ Годонина в Моравии. Однако с приближением зимы османские союзники отговорили его от продолжения осады. Бетлен удовольствовался новым договором, заключенным в Вене, который в общих чертах повторял условия Микуловского мира двухлетней давности. После неудачной попытки сватовства к дочери Фердинанда II, ради чего он даже был готов перейти в католичество, в 1626 г. в Кошицах Бетлен женился на Катарине Бранденбургской. Этот брак связал его с антигабсбургским союзом в составе Англии, Дании, Голландии и Швеции. В конце 1626 г. армия Бетлена пересекла Словакию с востока на запад, чтобы прийти на помощь остаткам армии протестантского герцога Мансфельда, который после поражения при Дессау в Силезии бежал от частей имперского военачальника Альбрехта Венцеля Валленштейна. На этот раз призыв Бетлена к словацким комитатам и городам остался практически без ответа, и только будайский паша Муртаза оказал ему некоторую помощь. В начале октября 1626 г. части Мансфельда соединились с отрядами Бетлена под Сеченем. Валленштейн, чьи войска загнали Мансфельда в Венгрию, не имел сил дать Бетлену решающее сражение. После нескольких недель, в течение которых солдаты занималась грабежами и разбоем, имперская армия вернулась в Австрию.
Прессбургский мир, подписанный в декабре 1626 г., увенчал третий поход Бетлена против Фердинанда II. Неожиданная смерть Бетлена в ноябре 1629 г. положила конец его честолюбивым планам создать антигабсбургскую коалицию вместе с шурином, шведским королем Густавом Адольфом. Его преемник Дёрдь I Ракоци сосредоточился на упрочении своей власти в Трансильвании и преумножении семейных владений. В течение 30-х годов XVII в. он практически не вмешивался в венгерские дела.
Рекатолизация, прерванная походами Бетлена, при Дёрде I Ракоци возобновилась с новой силой. Ее не замедлил даже приток в словацкие земли беженцев-некатоликов из Чехии и Моравии после мая 1627 г., когда католицизм был провозглашен единственной официальной религией в Чехии и был отдан приказ о насильственном обращении или изгнании некатоликов. К моменту созыва сейма 1638 г. католики составляли явное большинство в рядах магнатов. Протестанты были вынуждены перейти к обороне. В конце 30-х годов XVII в. с помощью Дёрдя I Ракоци протестанты пытались установить контакты с Швецией и Францией. Недовольство положением дел в габсбургской Венгрии высказывали не только протестанты, многие католические магнаты были озабочены централизаторскими устремлениями венского двора и все новыми ограничениями автономии венгерского дворянства. В период после 1625 г. палатин Миклош Эстерхази неоднократно выражал протест против неуважения, выказываемого Габсбургами в отношении венгерской конституции, и не раз грозил немедленной отставкой.
Тридцатилетняя война истощила имперскую казну. Габсбурги перестали получать регулярные поступления на поддержание системы пограничных крепостей и не имели средств оплачивать расположенные там гарнизоны. Оборонительные укрепления были в плачевном состоянии, личный состав гарнизонов месяцами не получал жалования, им приходилось добывать средства к существованию грабежом и разбоем, в особенности в пограничных районах, которые находились под властью турок. Группы мародеров, состоявшие из беглых имперских солдат, служили оправданием ответных турецких рейдов, так что локальные столкновения на границе лишь усиливались. Только в течение одной трехдневной карательной экспедиции в комитат Нитра в 1642 г. эстергомский бег Мустафа разграбил и сжег 11 деревень, двести человек было убито и более тысячи уведены в рабство.
2.6. Восстание Дёрдя I Ракоци
В начале 40-х годов XVII в., после вступления в Тридцатилетнюю войну Франции и интенсификации шведских атак, император Фердинанд III был вынужден перейти к обороне. Антигабсбургаская коалиция с надеждой обращала взоры на Дёрдя I Ракоци, который мог решить окончательный исход тридцати лет войны одним лишь рейдом на Вену. Величайшей удачей Фердинанда стало то, что в марте 1642 г. в деревне Сень на берегу Дуная, его представители во второй раз продлили Житваторокский мир с османами еще на двадцать лет (изначально он был действителен только до 1627 г.).