Смерть Драгута, враждебность окружающей территории, невероятная стойкость защитников, болезни в армии – все это было среди факторов, победивших османскую армию и флот. Вдохновенное лидерство и умная стратегия Великого магистра Ла Валетта также сказались на исходе осады. Защитникам удалось продержаться до прибытия подкрепления с Сицилии. Осада продлилась почти четыре месяца. «Оружие Сулеймана I, – писал У. Х. Прескотт в «Истории царствования Филиппа II», – за все время его долгого и славного правления еще сталкивалось с таким унизительным поражением, как при осаде Мальты. Не говоря уже о средствах, затраченных на военные приготовления, потери в живой силе были огромны…» Многие авторы едины в том, что турки потеряли от 20 000 до 30 000 человек – колоссальное число для того времени, причем оно не учитывает потери корсаров с Варварского берега. Во время правления Сулеймана, одного из самых славных периодов османской истории, он столкнулся только с двумя большими неудачами – у стен Вены в 1529 году и при осаде Мальты в 1565 году. Осада Мальты стала пиком османской экспансии. Важно то, что после этого турки не делали серьезных попыток прорваться в западную часть Средиземного моря.
Королева Елизавета I Английская, не испытывавшая особой любви ни к католикам, ни к испанцам, сказала во время осады: «Если турки овладеют Мальтой, трудно предвидеть, какие опасности могут последовать для остальных христианских государств». Одним из главных следствий осады стало привлечение внимания европейских держав к уникальному стратегическому положению Мальтийского архипелага. Они осознали, как это сделали римляне и карфагеняне до них, что остров Мальта не просто красив и обладает прекрасными гаванями. Он жизненно важное приобретение для любой державы, желающей править Средиземноморьем. Героическая оборона острова вызвала восхищение всего христианского мира, и финансовое положение рыцарей в одночасье существенно улучшилось. Годы забвения остались в прошлом. Образ рыцарей-иоаннитов оказался настолько неразрывно связанным с островом, что их стали называть мальтийскими рыцарями. Еще при жизни Великого магистра Ла Валетта был построен новый укрепленный город, названный его именем – на месте форта Святого Эльма. Мальта прославилась, ее осада стала легендой, которая впоследствии приобрела дополнительную силу во время еще более длительной осады в годы Второй мировой войны. А греческая народная песня, которую распевали по всему Средиземноморью, напоминала туркам, что они не всегда были непобедимыми:
Осада Мальты 1565 года стала тем моментом, когда якобы неодолимый османский поток был остановлен. Турки и мусульмане с североафриканского побережья еще долго будут нападать на морские пути Западного Средиземноморья, но основная волна уже утратила силу. О султане Сулеймане можно сказать следующее: хотя он не всегда признается европейскими историками, его достижения в реорганизации духовенства, реформировании и совершенствовании администрации своей страны и смягчении положения христианских подданных огромной империи дают ему право считаться турецким эквивалентом Юстиниана. Он и его великий противник Карл V были личностями одного масштаба. Правда, Сулейман был намного терпимее и имел более широкие взгляды, особенно в религиозных вопросах, чем Карл, гонитель мавров и лютеран. В отличие от империи Карла, которая распалась через несколько десятилетий после его смерти, империя Сулеймана просуществовала еще почти три столетия. Отпора на Мальте и неудачи в битве при Лепанто, третьем великом морском сражении этого периода, оказалось недостаточно, чтобы ослабить позиции турок в восточной части Средиземного моря и на прилегающих землях.