ревностную заботу о праве народа на выбор; непререкаемое согласие с решениями большинства; высокодисциплинированное ополчение, подчинение военного руководства гражданскому;
экономию государственных расходов;
честную выплату долгов и сохранение общественного доверия;
поощрение сельского хозяйства и торговли; распространение информации и вынесение всех злоупотреблений на суд общественного разума; религиозную свободу; свободу печати и свободу личности; суд свободно избираемых присяжных.
Джефферсон представил слушателям скорее изложение его убеждений, чем программу действий на будущее, в его речи не содержалось ничего революционного. Как показали все восемь лет его пребывания на президентском посту, он, будучи прагматиком, не находил ничего предосудительного в отступлении от провозглашаемых им принципов, если это диктовалось необходимостью в его собственном понимании. «Он был одним из самых сложных человеческих существ, когда-либо ступавших по нашей планете. Продолжают существовать потрясающие противоречия: интеллектуал с грубым телом человека физического труда; человек с руками, способными выполнить любую техническую работу, и человек Ренессанса; политик, знающий, как использовать федералистские приемы для достижения республиканских целей; идеалист, говоривший об освобождении негров, но освободивший лишь пятерых своих рабов, причем трое из них были, согласно утверждениям, детьми сводной сестры его жены, негритянки-полукровки; политический догматик, сохранявший свой разум открытым по всем другим вопросам; скептик, подвергавший сомнению существование Бога и отрицавший, что христианство является частью общего права, однако основывавший права человека на неубедительной теории естественных прав. Легко заметить, как он превратился во всеобщий символ всего существующего на земле, как смешались применяемые им средства с его целями, как его отдельные мысли — к примеру, его доктрины прав штатов — были неправедно использованы в целях, коренным образом отличных от его собственных», — отмечали спустя полтора века американские историки. Но современники Джефферсона прибегали либо к более комплиментарным, либо к более резким высказываниям в зависимости от их отношения к личности президента, хотя даже наиболее рьяные его противники, в числе которых был в первую очередь Гамильтон, не могли не признавать неординарности этого человека.
Придя к власти, Джефферсон первым делом амнистировал всех журналистов, осужденных по Законам об иностранцах и подстрекательстве к мятежу. Состав кабинета первой администрации Джефферсона свидетельствовал о серьезности намерений президента пересмотреть основные направления внешней и внутренней политики американского государства и, главное, обеспечить их претворение в жизнь без вмешательства в этот процесс федералистов. Министры, входившие в федералистские кабинеты его предшественников, уже в течение первых нескольких месяцев существования правительства республиканцев были заменены единомышленниками Джефферсона, что гарантировало отсутствовавшее в прежние годы единство в исполнительной ветви государственной власти. Президент предпринял также попытку ослабить влияние оппозиции и в Верховном суде США, проведя через конгресс отмену принятого в начале 1801 г. Закона о судоустройстве (Judiciary Act), позволившего Дж. Адамсу учредить полтора десятка новых федеральных судейских постов и назначить на них своих ставленников. Итогом этого конфликта между федералистами и республиканцами стало укрепление судебной ветви государственной власти и повышение роли ранее маловлиятельного Верховного суда США — результат, к которому Джефферсон вовсе и не стремился.
Уже в первые месяцы своей администрации Джефферсон, как и ожидалось от бывшего государственного секретаря США, стал проявлять повышенный интерес к проблемам взаимоотношений с другими странами. Однако практические возможности молодого американского государства заметно ограничивали его влияние на решение международных проблем.
Тем временем осложнялась ситуация на южных и северных границах США. На юге страны теряющая былое могущество Испания пыталась удержать за собой свои владения на побережье Мексиканского залива — Луизиану и Флориду. Некогда открытая французами Луизиана перешла к испанцам по Парижскому мирному договору 1763 г. Но в 1800 г. по заключенному с Наполеоном I секретному Сан-Ильдефонскому договору она была возвращена Франции, закрывшей Нью-Орлеанский порт для американских торговых кораблей. Фермеры Юга и промышленники развивающихся западных территорий Америки потеряли возможность вывозить продукты своего труда. Установление французского контроля над обширной территорией, простирающейся от р. Миссисипи до Скалистых гор, беспокоило администрацию Джефферсона.