Сиам получил несколько лет передышки — сначала благодаря династическим смутам в Бирме, затем в результате того, что преемники Алаунпаи в 1763—1765 гг. были заняты завоеванием Чиангмая и Луангпрабанга. Но эта передышка не была эффективно использована. Когда летом 1765 г. сравнительно небольшие силы бирманского короля Схинбьюшина вторглись в Сиам с севера и с запада, они почти не встретили сопротивления. Население при приближении бирманцев бежало в леса. К концу 1765 г. бирманцы оккупировали весь Юго-Западный и Северный Сиам (кроме Питсанулока, который пал позднее). В декабре они захватили Бангкок, отрезав столицу от моря. В феврале 1766 г. Аютия была полностью окружена. Войска Экатата, который после похода Алаунпаи опять вернулся на трон, всюду терпели поражение.
В то же время террор бирманских войск в захваченных областях стал порождать народное сопротивление. На первых порах оно еще было слабым и неорганизованным. Но в районе деревни Банграчан пятитысячный партизанский отряд в течение многих месяцев оказывал героическое сопротивление и выдержал семь атак превосходящих сил противника, прежде чем был рассеян. И это явилось первым предвестником народно-освободительной войны, которая разгорелась полтора года спустя.
Между тем осада Аютии продолжалась. Надежда на то, что бирманцы уйдут с началом летних дождей, оказалась тщетной. Командующий осадной армией генерал Маха Нората возвел вокруг Аютии форты на холмах, лежащих выше зоны затопления, и реквизировал достаточное количество лодок, чтобы блокировать сиамскую столицу и во время разлива. Голод и болезни в осажденном городе приняли огромные размеры. Очевидец, французский миссионер Корре, который рассматривал события со своей, специфической точки зрения, доносил в это время в Париж: «Гром войны загнал весь народ в столицу, и провидение, таким образом, приблизило к нам то, что в прошедшие годы мы искали вдали. Я говорю об умирающих детях. Раньше с колоссальным трудом нам приходилось их разыскивать по деревням. Сейчас господь нас избавил от этого труда и столица дает нам обильный урожай. Раньше за 15 дней непрерывной ходьбы с утра до вечера удавалось окрестить от силы 40 таких детей. Теперь же благодаря милосердию нашего любимого спасителя не редкость, что за один день их набирается до 60. И вечером мы не возвращаемся удовлетворенные в семинарию, если окрестили их за день меньше 30». По сводкам французских католических миссионеров, за год осады (февраль 1766—апрель 1767) в Аютии и ее окрестностях было крещено 10 тыс. умирающих детей. Число детей, умерших без этого обряда, никто не подсчитывал.
Попытки сиамцев прорвать блокаду во время разлива Менама (против бирманцев было выслано 160 судов с тремя пушками каждое) потерпели крах. Бездарный и неуравновешенный Экатат требовал, чтобы каждый выстрел крепостной артиллерии согласовывался с ним, и срывал свою злобу на наиболее способных военачальниках. Вызвавший его гнев генерал Пья Таксин вынужден был бежать из Аютии вместе с 500 своими приверженцами. Этим, кстати, он доказал, что линия бирманской блокады не так уж непреодолима.
В обстановке замешательства при дворе епископ Бриго, опиравшийся на христианские формирования, снова стал видной политической фигурой. Рушащаяся аютийская монархия готова была удовлетворить все притязания епископа. Ему выделили 30 пушек с боеприпасами для давно уже превращенных в небольшие крепости трех загородных церквей и крупную сумму денег. Вскоре, однако, епископ решил, что поставил не на ту карту. Современным наблюдателям казалось, что Сиам ожидают долгие годы бирманского господства. В такой обстановке миссионеры сочли за лучшее заранее наладить хорошие отношения с новым хозяином.
21 марта 1767 г. капитулировала португальская слобода, где обороной руководили доминиканцы и иезуиты. На следующий день, после переговоров с бирманским главнокомандующим, капитулировал на выгодных условиях и епископ Бриго. Все солдаты-христиане были немедленно зачислены в бирманскую армию. Неизвестно, участвовали ли они в дальнейшем штурме Аютии, но ясно, что и без того гарнизон столицы, лишенный значительной части огневых средств и ключевых укреплений, не мог уже долго держаться. В ночь на 8 апреля город, несмотря на отчаянное сопротивление его защитников, был взят штурмом и сожжен дотла.
Все население было уведено в плен в Бирму. Туда же, хотя и с гораздо большим комфортом, отправился епископ Бриго. Бирманское командование предоставило ему 12 носильщиков. Экатат пропал без вести. Некоторые говорили, что он умер от голода, скитаясь в джунглях.